RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NischQ80TM9 1593 aa26.97■■□□□ 1.91
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa26.56■■□□□ 1.84
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abcc9P70170 1546 aa26.17■■□□□ 1.78
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abcc8B2RUS7 1588 aa25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rhox8Q6VSS7 320 aa24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rtl1Q7M732 1744 aa24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ScribQ80U72 1612 aa24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dcaf1Q80TR8 1506 aa23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc180J3QNE4 1664 aa23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kdm5dQ62240 1548 aa23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NacadQ5SWP3 1504 aa23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Baz1aO88379 1555 aa23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sycp2Q9CUU3 1500 aa22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Smarca2Q6DIC0 1577 aa22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 HrcG5E8J6 738 aa22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trim41Q5NCC3 630 aa22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BicraF8VPZ9 1578 aa22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa22.35■■□□□ 1.17
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cep164Q5DU05 1446 aa22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Synj1Q8CHC4 1574 aa22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cngb1E1AZ71 1325 aa22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Chic1Q8CBW7 227 aa21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CftrP26361 1476 aa21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Golga3P55937 1487 aa21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gab3Q8BSM5 595 aa21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Top2bQ64511 1612 aa21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fmn1Q05860 1466 aa21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa21.24■□□□□ 0.99
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Frmpd1A2AKB4 1549 aa21.17■□□□□ 0.98
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wdr62Q3U3T8 1523 aa21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TnnQ80Z71 1560 aa21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cep162Q6ZQ06 1403 aa21.08■□□□□ 0.96
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myt1lP97500 1187 aa21■□□□□ 0.95
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mier1Q5UAK0 511 aa20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ercc6F8VPZ5 1481 aa20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Npm2Q80W85 207 aa20.98■□□□□ 0.95
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lamc3Q9R0B6 1581 aa20.95■□□□□ 0.94
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Unc13aQ4KUS2 1712 aa20.93■□□□□ 0.94
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pcgf6Q99NA9 353 aa20.91■□□□□ 0.94
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kif15Q6P9L6 1387 aa20.9■□□□□ 0.94
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Il27Q8K3I6 234 aa20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PtprkP35822 1457 aa20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 UbtfP25976 765 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NefmP08553 848 aa20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arhgap35Q91YM2 1499 aa20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Camsap1A2AHC3 1581 aa20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NrkQ9R0G8 1455 aa20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Clip1Q922J3 1391 aa20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Shroom4Q1W617 1475 aa20.69■□□□□ 0.9
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zeb1Q64318 1117 aa20.65■□□□□ 0.9
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc18Q640L5 1455 aa20.65■□□□□ 0.9
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Grin2bQ01097 1482 aa20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ubl4bQ9CQ84 188 aa20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cux2P70298 1426 aa20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Map3k1P53349 1493 aa20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arap1Q4LDD4 1452 aa20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Eea1Q8BL66 1411 aa20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam135aQ6NS59 1506 aa20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Setd5Q5XJV7 1441 aa20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Baz1bQ9Z277 1479 aa20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Efcab5A0JP43 1406 aa20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankrd26Q811D2 1581 aa20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Duox2A2AQ99 1517 aa20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Erich3F6QRE9 1637 aa20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sall2Q9QX96 1004 aa20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tiam1Q60610 1591 aa20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Carmil1Q6EDY6 1374 aa20.27■□□□□ 0.83
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Naip1Q9QWK5 1403 aa20.26■□□□□ 0.83
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.8 ms