Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q9

Pmis2, Pmis2, sperm-specific protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmis2Q497Q9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Pmis2Q497Q9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Pmis2Q497Q9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Pmis2Q497Q9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Pmis2Q497Q9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,38
Pmis2Q497Q9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Pmis2Q497Q9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,43■■□□□ 1,34
Pmis2Q497Q9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Pmis2Q497Q9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Pmis2Q497Q9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Pmis2Q497Q9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Pmis2Q497Q9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
Pmis2Q497Q9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Pmis2Q497Q9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Pmis2Q497Q9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Pmis2Q497Q9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Pmis2Q497Q9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Pmis2Q497Q9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Pmis2Q497Q9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Pmis2Q497Q9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Pmis2Q497Q9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Pmis2Q497Q9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Pmis2Q497Q9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Pmis2Q497Q9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Pmis2Q497Q9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Pmis2Q497Q9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Pmis2Q497Q9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Pmis2Q497Q9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
Pmis2Q497Q9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Pmis2Q497Q9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Pmis2Q497Q9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,6■■□□□ 1,05
Pmis2Q497Q9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Pmis2Q497Q9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Pmis2Q497Q9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Pmis2Q497Q9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Pmis2Q497Q9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Pmis2Q497Q9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Pmis2Q497Q9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Pmis2Q497Q9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,27■■□□□ 1
Pmis2Q497Q9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Pmis2Q497Q9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Pmis2Q497Q9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,22■□□□□ 0,99
Pmis2Q497Q9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Pmis2Q497Q9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Pmis2Q497Q9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Pmis2Q497Q9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Pmis2Q497Q9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Pmis2Q497Q9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Pmis2Q497Q9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Pmis2Q497Q9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Pmis2Q497Q9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,03■□□□□ 0,96
Pmis2Q497Q9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Pmis2Q497Q9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Pmis2Q497Q9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Pmis2Q497Q9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Pmis2Q497Q9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Pmis2Q497Q9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Pmis2Q497Q9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Pmis2Q497Q9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Pmis2Q497Q9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Pmis2Q497Q9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Pmis2Q497Q9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Pmis2Q497Q9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Pmis2Q497Q9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Pmis2Q497Q9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Pmis2Q497Q9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,71■□□□□ 0,91
Pmis2Q497Q9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,91
Pmis2Q497Q9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Pmis2Q497Q9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Pmis2Q497Q9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Pmis2Q497Q9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Pmis2Q497Q9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Pmis2Q497Q9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Pmis2Q497Q9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Pmis2Q497Q9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Pmis2Q497Q9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Pmis2Q497Q9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Pmis2Q497Q9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Pmis2Q497Q9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Pmis2Q497Q9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Pmis2Q497Q9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Pmis2Q497Q9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Pmis2Q497Q9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Pmis2Q497Q9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,34■□□□□ 0,85
Pmis2Q497Q9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Pmis2Q497Q9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Pmis2Q497Q9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Pmis2Q497Q9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Pmis2Q497Q9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Pmis2Q497Q9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Pmis2Q497Q9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Pmis2Q497Q9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Pmis2Q497Q9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Pmis2Q497Q9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Pmis2Q497Q9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Pmis2Q497Q9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Pmis2Q497Q9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,15■□□□□ 0,82
Pmis2Q497Q9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Pmis2Q497Q9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Pmis2Q497Q9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms