Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Cited2O35740 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cited2O35740 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cited2O35740 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cited2O35740 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cited2O35740 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cited2O35740 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cited2O35740 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cited2O35740 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cited2O35740 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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Cited2O35740 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cited2O35740 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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