Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Obox1Q9D350 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Obox1Q9D350 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Obox1Q9D350 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Obox1Q9D350 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Obox1Q9D350 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
Obox1Q9D350 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Obox1Q9D350 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Obox1Q9D350 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Obox1Q9D350 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,55■■□□□ 1,36
Obox1Q9D350 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Obox1Q9D350 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Obox1Q9D350 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Obox1Q9D350 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,08■■□□□ 1,29
Obox1Q9D350 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,05■■□□□ 1,28
Obox1Q9D350 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Obox1Q9D350 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Obox1Q9D350 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Obox1Q9D350 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Obox1Q9D350 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Obox1Q9D350 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Obox1Q9D350 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Obox1Q9D350 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,46■■□□□ 1,19
Obox1Q9D350 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Obox1Q9D350 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Obox1Q9D350 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Obox1Q9D350 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Obox1Q9D350 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,37■■□□□ 1,17
Obox1Q9D350 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Obox1Q9D350 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Obox1Q9D350 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Obox1Q9D350 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Obox1Q9D350 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Obox1Q9D350 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Obox1Q9D350 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Obox1Q9D350 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
Obox1Q9D350 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Obox1Q9D350 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Obox1Q9D350 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Obox1Q9D350 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Obox1Q9D350 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Obox1Q9D350 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Obox1Q9D350 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Obox1Q9D350 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Obox1Q9D350 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
Obox1Q9D350 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Obox1Q9D350 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Obox1Q9D350 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Obox1Q9D350 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,63■■□□□ 1,05
Obox1Q9D350 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Obox1Q9D350 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Obox1Q9D350 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Obox1Q9D350 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Obox1Q9D350 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Obox1Q9D350 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Obox1Q9D350 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Obox1Q9D350 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Obox1Q9D350 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,27■■□□□ 1
Obox1Q9D350 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Obox1Q9D350 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Obox1Q9D350 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,2■□□□□ 0,98
Obox1Q9D350 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Obox1Q9D350 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Obox1Q9D350 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Obox1Q9D350 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Obox1Q9D350 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Obox1Q9D350 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Obox1Q9D350 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Obox1Q9D350 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Obox1Q9D350 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Obox1Q9D350 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Obox1Q9D350 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Obox1Q9D350 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Obox1Q9D350 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Obox1Q9D350 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Obox1Q9D350 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Obox1Q9D350 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Obox1Q9D350 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Obox1Q9D350 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Obox1Q9D350 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Obox1Q9D350 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Obox1Q9D350 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Obox1Q9D350 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Obox1Q9D350 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Obox1Q9D350 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,71■□□□□ 0,91
Obox1Q9D350 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Obox1Q9D350 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Obox1Q9D350 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Obox1Q9D350 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Obox1Q9D350 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Obox1Q9D350 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Obox1Q9D350 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Obox1Q9D350 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Obox1Q9D350 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Obox1Q9D350 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Obox1Q9D350 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Obox1Q9D350 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Obox1Q9D350 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Obox1Q9D350 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Obox1Q9D350 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20,51■□□□□ 0,87
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