Protein–RNA interactions for Protein: P60041

Sst, Somatostatin, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SstP60041 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SstP60041 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SstP60041 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SstP60041 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SstP60041 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SstP60041 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SstP60041 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SstP60041 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SstP60041 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SstP60041 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SstP60041 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SstP60041 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SstP60041 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SstP60041 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SstP60041 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SstP60041 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SstP60041 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SstP60041 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SstP60041 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SstP60041 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SstP60041 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SstP60041 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SstP60041 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SstP60041 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SstP60041 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SstP60041 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SstP60041 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SstP60041 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SstP60041 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SstP60041 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SstP60041 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SstP60041 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SstP60041 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SstP60041 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SstP60041 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SstP60041 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SstP60041 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SstP60041 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SstP60041 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SstP60041 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SstP60041 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SstP60041 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SstP60041 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SstP60041 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SstP60041 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SstP60041 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SstP60041 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SstP60041 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SstP60041 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SstP60041 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SstP60041 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SstP60041 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SstP60041 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SstP60041 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SstP60041 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SstP60041 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SstP60041 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SstP60041 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SstP60041 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SstP60041 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SstP60041 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SstP60041 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SstP60041 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SstP60041 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SstP60041 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SstP60041 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SstP60041 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SstP60041 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SstP60041 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SstP60041 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SstP60041 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SstP60041 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SstP60041 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SstP60041 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SstP60041 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SstP60041 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SstP60041 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SstP60041 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SstP60041 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SstP60041 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SstP60041 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SstP60041 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SstP60041 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SstP60041 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SstP60041 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SstP60041 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SstP60041 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SstP60041 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SstP60041 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SstP60041 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SstP60041 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SstP60041 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SstP60041 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SstP60041 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SstP60041 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SstP60041 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SstP60041 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SstP60041 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SstP60041 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SstP60041 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms