Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,7■■■■□ 3,47
AY761185Q5ERI8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
AY761185Q5ERI8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
AY761185Q5ERI8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,59■■■□□ 2,81
AY761185Q5ERI8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
AY761185Q5ERI8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
AY761185Q5ERI8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
AY761185Q5ERI8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
AY761185Q5ERI8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
AY761185Q5ERI8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,79■■■□□ 2,52
AY761185Q5ERI8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
AY761185Q5ERI8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,56■■■□□ 2,48
AY761185Q5ERI8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,43■■■□□ 2,46
AY761185Q5ERI8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
AY761185Q5ERI8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,25■■■□□ 2,43
AY761185Q5ERI8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
AY761185Q5ERI8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
AY761185Q5ERI8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,45■■■□□ 2,31
AY761185Q5ERI8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
AY761185Q5ERI8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
AY761185Q5ERI8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,17■■■□□ 2,26
AY761185Q5ERI8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
AY761185Q5ERI8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
AY761185Q5ERI8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
AY761185Q5ERI8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,65■■■□□ 2,18
AY761185Q5ERI8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,17
AY761185Q5ERI8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,61■■■□□ 2,17
AY761185Q5ERI8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
AY761185Q5ERI8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
AY761185Q5ERI8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
AY761185Q5ERI8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
AY761185Q5ERI8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
AY761185Q5ERI8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
AY761185Q5ERI8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
AY761185Q5ERI8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
AY761185Q5ERI8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
AY761185Q5ERI8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,76■■■□□ 2,03
AY761185Q5ERI8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
AY761185Q5ERI8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
AY761185Q5ERI8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
AY761185Q5ERI8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
AY761185Q5ERI8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
AY761185Q5ERI8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
AY761185Q5ERI8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
AY761185Q5ERI8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
AY761185Q5ERI8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
AY761185Q5ERI8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
AY761185Q5ERI8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
AY761185Q5ERI8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
AY761185Q5ERI8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
AY761185Q5ERI8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,95■■□□□ 1,9
AY761185Q5ERI8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26,89■■□□□ 1,9
AY761185Q5ERI8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
AY761185Q5ERI8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,86■■□□□ 1,89
AY761185Q5ERI8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26,8■■□□□ 1,88
AY761185Q5ERI8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
AY761185Q5ERI8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
AY761185Q5ERI8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
AY761185Q5ERI8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
AY761185Q5ERI8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
AY761185Q5ERI8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,62■■□□□ 1,85
AY761185Q5ERI8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
AY761185Q5ERI8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,54■■□□□ 1,84
AY761185Q5ERI8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
AY761185Q5ERI8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
AY761185Q5ERI8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
AY761185Q5ERI8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
AY761185Q5ERI8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
AY761185Q5ERI8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
AY761185Q5ERI8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26,33■■□□□ 1,81
AY761185Q5ERI8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
AY761185Q5ERI8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
AY761185Q5ERI8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
AY761185Q5ERI8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
AY761185Q5ERI8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
AY761185Q5ERI8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,16■■□□□ 1,78
AY761185Q5ERI8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
AY761185Q5ERI8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
AY761185Q5ERI8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
AY761185Q5ERI8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
AY761185Q5ERI8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
AY761185Q5ERI8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
AY761185Q5ERI8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
AY761185Q5ERI8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
AY761185Q5ERI8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
AY761185Q5ERI8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
AY761185Q5ERI8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
AY761185Q5ERI8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,96■■□□□ 1,75
AY761185Q5ERI8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
AY761185Q5ERI8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
AY761185Q5ERI8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
AY761185Q5ERI8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
AY761185Q5ERI8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,74
AY761185Q5ERI8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
AY761185Q5ERI8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
AY761185Q5ERI8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
AY761185Q5ERI8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
AY761185Q5ERI8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
AY761185Q5ERI8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
AY761185Q5ERI8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms