Protein–RNA interactions for Protein: P01750

Ig heavy chain V region 102, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01750 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
P01750 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P01750 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01750 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01750 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01750 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01750 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
P01750 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
P01750 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01750 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
P01750 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01750 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01750 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
P01750 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
P01750 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01750 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01750 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01750 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01750 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01750 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01750 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01750 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01750 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01750 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01750 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01750 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P01750 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P01750 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01750 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01750 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01750 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01750 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01750 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01750 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01750 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01750 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01750 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01750 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01750 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01750 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01750 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
P01750 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01750 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01750 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01750 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
P01750 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01750 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01750 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01750 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01750 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01750 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01750 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01750 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01750 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01750 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01750 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P01750 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01750 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01750 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01750 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01750 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01750 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01750 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01750 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P01750 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01750 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01750 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P01750 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01750 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01750 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01750 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01750 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01750 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01750 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01750 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01750 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01750 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01750 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01750 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01750 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01750 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01750 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01750 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01750 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P01750 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01750 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P01750 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P01750 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
P01750 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P01750 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
P01750 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
P01750 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
P01750 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
P01750 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
P01750 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
P01750 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
P01750 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
P01750 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
P01750 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
P01750 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms