Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
MsmbO08540 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
MsmbO08540 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
MsmbO08540 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
MsmbO08540 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
MsmbO08540 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
MsmbO08540 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
MsmbO08540 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
MsmbO08540 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
MsmbO08540 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
MsmbO08540 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
MsmbO08540 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
MsmbO08540 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,1■■□□□ 1,45
MsmbO08540 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
MsmbO08540 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
MsmbO08540 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
MsmbO08540 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
MsmbO08540 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
MsmbO08540 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
MsmbO08540 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
MsmbO08540 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
MsmbO08540 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
MsmbO08540 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
MsmbO08540 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
MsmbO08540 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,35■■□□□ 1,33
MsmbO08540 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
MsmbO08540 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
MsmbO08540 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,32■■□□□ 1,32
MsmbO08540 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
MsmbO08540 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,14■■□□□ 1,29
MsmbO08540 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
MsmbO08540 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
MsmbO08540 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,96■■□□□ 1,27
MsmbO08540 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
MsmbO08540 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
MsmbO08540 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
MsmbO08540 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
MsmbO08540 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
MsmbO08540 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
MsmbO08540 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,75■■□□□ 1,23
MsmbO08540 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
MsmbO08540 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,63■■□□□ 1,21
MsmbO08540 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
MsmbO08540 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
MsmbO08540 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
MsmbO08540 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,5■■□□□ 1,19
MsmbO08540 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
MsmbO08540 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
MsmbO08540 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,44■■□□□ 1,18
MsmbO08540 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
MsmbO08540 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
MsmbO08540 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
MsmbO08540 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
MsmbO08540 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,26■■□□□ 1,15
MsmbO08540 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,25■■□□□ 1,15
MsmbO08540 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
MsmbO08540 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,22■■□□□ 1,15
MsmbO08540 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
MsmbO08540 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
MsmbO08540 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
MsmbO08540 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
MsmbO08540 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
MsmbO08540 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
MsmbO08540 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
MsmbO08540 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
MsmbO08540 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
MsmbO08540 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,95■■□□□ 1,1
MsmbO08540 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
MsmbO08540 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
MsmbO08540 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,89■■□□□ 1,09
MsmbO08540 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
MsmbO08540 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
MsmbO08540 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
MsmbO08540 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,83■■□□□ 1,09
MsmbO08540 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
MsmbO08540 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
MsmbO08540 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,79■■□□□ 1,08
MsmbO08540 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,07
MsmbO08540 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,72■■□□□ 1,07
MsmbO08540 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
MsmbO08540 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
MsmbO08540 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
MsmbO08540 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,67■■□□□ 1,06
MsmbO08540 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,64■■□□□ 1,05
MsmbO08540 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
MsmbO08540 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
MsmbO08540 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
MsmbO08540 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,53■■□□□ 1,04
MsmbO08540 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
MsmbO08540 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,51■■□□□ 1,03
MsmbO08540 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
MsmbO08540 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
MsmbO08540 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
MsmbO08540 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
MsmbO08540 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
MsmbO08540 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
MsmbO08540 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
MsmbO08540 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
MsmbO08540 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
MsmbO08540 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
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