Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cacng7P62956 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacng7P62956 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacng7P62956 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacng7P62956 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacng7P62956 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacng7P62956 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacng7P62956 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacng7P62956 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng7P62956 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng7P62956 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng7P62956 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacng7P62956 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng7P62956 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng7P62956 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacng7P62956 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng7P62956 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacng7P62956 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng7P62956 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng7P62956 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacng7P62956 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacng7P62956 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng7P62956 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng7P62956 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng7P62956 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacng7P62956 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng7P62956 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacng7P62956 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacng7P62956 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacng7P62956 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacng7P62956 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacng7P62956 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacng7P62956 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacng7P62956 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacng7P62956 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacng7P62956 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacng7P62956 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacng7P62956 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacng7P62956 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacng7P62956 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacng7P62956 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacng7P62956 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacng7P62956 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacng7P62956 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacng7P62956 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacng7P62956 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacng7P62956 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacng7P62956 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacng7P62956 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacng7P62956 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng7P62956 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cacng7P62956 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng7P62956 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacng7P62956 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacng7P62956 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacng7P62956 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacng7P62956 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacng7P62956 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacng7P62956 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacng7P62956 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacng7P62956 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacng7P62956 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacng7P62956 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacng7P62956 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacng7P62956 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacng7P62956 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacng7P62956 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacng7P62956 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacng7P62956 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacng7P62956 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacng7P62956 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacng7P62956 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacng7P62956 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacng7P62956 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacng7P62956 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacng7P62956 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cacng7P62956 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cacng7P62956 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacng7P62956 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cacng7P62956 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cacng7P62956 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacng7P62956 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cacng7P62956 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacng7P62956 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacng7P62956 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacng7P62956 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacng7P62956 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacng7P62956 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacng7P62956 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacng7P62956 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacng7P62956 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacng7P62956 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacng7P62956 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacng7P62956 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacng7P62956 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacng7P62956 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng7P62956 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacng7P62956 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacng7P62956 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacng7P62956 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms