Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Usp9xP70398 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Usp9xP70398 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Usp9xP70398 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp9xP70398 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp9xP70398 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp9xP70398 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp9xP70398 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp9xP70398 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp9xP70398 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp9xP70398 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp9xP70398 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp9xP70398 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp9xP70398 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp9xP70398 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp9xP70398 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp9xP70398 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp9xP70398 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp9xP70398 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp9xP70398 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp9xP70398 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp9xP70398 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp9xP70398 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp9xP70398 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp9xP70398 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp9xP70398 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp9xP70398 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp9xP70398 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp9xP70398 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp9xP70398 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp9xP70398 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp9xP70398 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp9xP70398 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp9xP70398 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp9xP70398 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp9xP70398 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp9xP70398 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp9xP70398 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp9xP70398 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp9xP70398 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp9xP70398 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp9xP70398 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp9xP70398 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp9xP70398 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp9xP70398 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp9xP70398 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp9xP70398 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp9xP70398 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp9xP70398 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp9xP70398 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp9xP70398 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp9xP70398 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp9xP70398 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp9xP70398 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp9xP70398 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp9xP70398 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp9xP70398 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp9xP70398 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp9xP70398 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp9xP70398 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp9xP70398 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp9xP70398 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp9xP70398 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp9xP70398 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp9xP70398 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp9xP70398 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp9xP70398 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp9xP70398 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp9xP70398 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp9xP70398 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp9xP70398 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp9xP70398 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp9xP70398 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp9xP70398 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp9xP70398 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp9xP70398 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp9xP70398 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp9xP70398 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp9xP70398 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp9xP70398 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp9xP70398 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp9xP70398 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp9xP70398 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp9xP70398 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp9xP70398 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp9xP70398 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp9xP70398 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp9xP70398 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp9xP70398 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp9xP70398 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp9xP70398 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp9xP70398 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp9xP70398 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp9xP70398 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp9xP70398 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp9xP70398 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp9xP70398 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp9xP70398 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp9xP70398 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp9xP70398 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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