Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,23■■■■□ 3,07
Usp9xP70398 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Usp9xP70398 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Usp9xP70398 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Usp9xP70398 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Usp9xP70398 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Usp9xP70398 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Usp9xP70398 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Usp9xP70398 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Usp9xP70398 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Usp9xP70398 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Usp9xP70398 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Usp9xP70398 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Usp9xP70398 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Usp9xP70398 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Usp9xP70398 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Usp9xP70398 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Usp9xP70398 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Usp9xP70398 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Usp9xP70398 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Usp9xP70398 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Usp9xP70398 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Usp9xP70398 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Usp9xP70398 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Usp9xP70398 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Usp9xP70398 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Usp9xP70398 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Usp9xP70398 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Usp9xP70398 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Usp9xP70398 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Usp9xP70398 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Usp9xP70398 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Usp9xP70398 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Usp9xP70398 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Usp9xP70398 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Usp9xP70398 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Usp9xP70398 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Usp9xP70398 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Usp9xP70398 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Usp9xP70398 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Usp9xP70398 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Usp9xP70398 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Usp9xP70398 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,7■■□□□ 1,71
Usp9xP70398 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Usp9xP70398 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Usp9xP70398 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Usp9xP70398 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Usp9xP70398 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Usp9xP70398 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Usp9xP70398 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Usp9xP70398 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Usp9xP70398 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Usp9xP70398 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Usp9xP70398 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Usp9xP70398 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Usp9xP70398 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Usp9xP70398 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Usp9xP70398 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Usp9xP70398 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Usp9xP70398 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Usp9xP70398 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Usp9xP70398 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Usp9xP70398 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Usp9xP70398 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Usp9xP70398 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Usp9xP70398 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Usp9xP70398 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Usp9xP70398 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Usp9xP70398 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Usp9xP70398 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Usp9xP70398 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Usp9xP70398 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Usp9xP70398 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Usp9xP70398 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Usp9xP70398 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Usp9xP70398 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Usp9xP70398 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Usp9xP70398 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Usp9xP70398 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Usp9xP70398 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Usp9xP70398 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
Usp9xP70398 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Usp9xP70398 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Usp9xP70398 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Usp9xP70398 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Usp9xP70398 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Usp9xP70398 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Usp9xP70398 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Usp9xP70398 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Usp9xP70398 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Usp9xP70398 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,33■■□□□ 1,49
Usp9xP70398 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Usp9xP70398 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Usp9xP70398 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Usp9xP70398 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Usp9xP70398 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Usp9xP70398 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Usp9xP70398 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Usp9xP70398 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Usp9xP70398 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
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