Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccl21cP86793 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccl21cP86793 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccl21cP86793 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccl21cP86793 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccl21cP86793 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccl21cP86793 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccl21cP86793 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccl21cP86793 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccl21cP86793 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccl21cP86793 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccl21cP86793 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccl21cP86793 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccl21cP86793 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccl21cP86793 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccl21cP86793 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccl21cP86793 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccl21cP86793 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccl21cP86793 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccl21cP86793 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccl21cP86793 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccl21cP86793 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccl21cP86793 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccl21cP86793 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccl21cP86793 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccl21cP86793 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccl21cP86793 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccl21cP86793 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccl21cP86793 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccl21cP86793 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccl21cP86793 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccl21cP86793 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccl21cP86793 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccl21cP86793 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccl21cP86793 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccl21cP86793 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccl21cP86793 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccl21cP86793 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccl21cP86793 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccl21cP86793 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccl21cP86793 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccl21cP86793 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccl21cP86793 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccl21cP86793 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccl21cP86793 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccl21cP86793 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccl21cP86793 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccl21cP86793 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccl21cP86793 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccl21cP86793 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccl21cP86793 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccl21cP86793 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccl21cP86793 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccl21cP86793 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccl21cP86793 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccl21cP86793 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccl21cP86793 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccl21cP86793 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccl21cP86793 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccl21cP86793 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccl21cP86793 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccl21cP86793 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccl21cP86793 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccl21cP86793 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccl21cP86793 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccl21cP86793 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccl21cP86793 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccl21cP86793 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccl21cP86793 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccl21cP86793 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccl21cP86793 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccl21cP86793 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccl21cP86793 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccl21cP86793 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccl21cP86793 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccl21cP86793 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccl21cP86793 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccl21cP86793 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccl21cP86793 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccl21cP86793 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccl21cP86793 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccl21cP86793 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccl21cP86793 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccl21cP86793 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccl21cP86793 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccl21cP86793 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccl21cP86793 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccl21cP86793 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccl21cP86793 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccl21cP86793 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccl21cP86793 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccl21cP86793 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccl21cP86793 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccl21cP86793 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccl21cP86793 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccl21cP86793 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccl21cP86793 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccl21cP86793 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccl21cP86793 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccl21cP86793 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms