Protein–RNA interactions for Protein: Q4QY32

Gm6040, Beta-defensin 51, mousemouse

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Length 63 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6040Q4QY32 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm6040Q4QY32 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Gm6040Q4QY32 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Gm6040Q4QY32 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Gm6040Q4QY32 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,48■■□□□ 1,35
Gm6040Q4QY32 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Gm6040Q4QY32 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Gm6040Q4QY32 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Gm6040Q4QY32 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Gm6040Q4QY32 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Gm6040Q4QY32 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Gm6040Q4QY32 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Gm6040Q4QY32 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
Gm6040Q4QY32 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Gm6040Q4QY32 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Gm6040Q4QY32 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Gm6040Q4QY32 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,26■■□□□ 1,15
Gm6040Q4QY32 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Gm6040Q4QY32 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Gm6040Q4QY32 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,03■■□□□ 1,12
Gm6040Q4QY32 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Gm6040Q4QY32 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Gm6040Q4QY32 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Gm6040Q4QY32 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Gm6040Q4QY32 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Gm6040Q4QY32 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Gm6040Q4QY32 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Gm6040Q4QY32 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Gm6040Q4QY32 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Gm6040Q4QY32 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Gm6040Q4QY32 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Gm6040Q4QY32 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Gm6040Q4QY32 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Gm6040Q4QY32 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,49■■□□□ 1,03
Gm6040Q4QY32 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,48■■□□□ 1,03
Gm6040Q4QY32 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Gm6040Q4QY32 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Gm6040Q4QY32 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,02
Gm6040Q4QY32 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,33■■□□□ 1,01
Gm6040Q4QY32 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Gm6040Q4QY32 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Gm6040Q4QY32 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Gm6040Q4QY32 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,14■□□□□ 0,97
Gm6040Q4QY32 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Gm6040Q4QY32 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Gm6040Q4QY32 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Gm6040Q4QY32 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Gm6040Q4QY32 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Gm6040Q4QY32 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Gm6040Q4QY32 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Gm6040Q4QY32 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Gm6040Q4QY32 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Gm6040Q4QY32 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Gm6040Q4QY32 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Gm6040Q4QY32 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Gm6040Q4QY32 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Gm6040Q4QY32 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Gm6040Q4QY32 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Gm6040Q4QY32 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Gm6040Q4QY32 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Gm6040Q4QY32 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Gm6040Q4QY32 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Gm6040Q4QY32 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Gm6040Q4QY32 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Gm6040Q4QY32 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,61■□□□□ 0,89
Gm6040Q4QY32 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Gm6040Q4QY32 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Gm6040Q4QY32 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Gm6040Q4QY32 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Gm6040Q4QY32 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Gm6040Q4QY32 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Gm6040Q4QY32 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Gm6040Q4QY32 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Gm6040Q4QY32 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Gm6040Q4QY32 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Gm6040Q4QY32 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Gm6040Q4QY32 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
Gm6040Q4QY32 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Gm6040Q4QY32 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Gm6040Q4QY32 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,24■□□□□ 0,83
Gm6040Q4QY32 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,83
Gm6040Q4QY32 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Gm6040Q4QY32 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,18■□□□□ 0,82
Gm6040Q4QY32 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,17■□□□□ 0,82
Gm6040Q4QY32 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Gm6040Q4QY32 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Gm6040Q4QY32 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Gm6040Q4QY32 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Gm6040Q4QY32 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Gm6040Q4QY32 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,04■□□□□ 0,8
Gm6040Q4QY32 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Gm6040Q4QY32 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Gm6040Q4QY32 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm6040Q4QY32 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm6040Q4QY32 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Gm6040Q4QY32 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Gm6040Q4QY32 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Gm6040Q4QY32 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Gm6040Q4QY32 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Gm6040Q4QY32 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
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