Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
Rbfox3Q8BIF2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rbfox3Q8BIF2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rbfox3Q8BIF2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Rbfox3Q8BIF2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Rbfox3Q8BIF2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,57■■□□□ 1,52
Rbfox3Q8BIF2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Rbfox3Q8BIF2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,99■■□□□ 1,43
Rbfox3Q8BIF2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Rbfox3Q8BIF2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
Rbfox3Q8BIF2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Rbfox3Q8BIF2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Rbfox3Q8BIF2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
Rbfox3Q8BIF2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rbfox3Q8BIF2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,36■■□□□ 1,33
Rbfox3Q8BIF2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Rbfox3Q8BIF2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Rbfox3Q8BIF2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Rbfox3Q8BIF2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Rbfox3Q8BIF2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Rbfox3Q8BIF2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Rbfox3Q8BIF2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Rbfox3Q8BIF2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Rbfox3Q8BIF2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Rbfox3Q8BIF2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Rbfox3Q8BIF2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Rbfox3Q8BIF2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Rbfox3Q8BIF2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Rbfox3Q8BIF2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
Rbfox3Q8BIF2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Rbfox3Q8BIF2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Rbfox3Q8BIF2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,6■■□□□ 1,21
Rbfox3Q8BIF2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Rbfox3Q8BIF2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,53■■□□□ 1,2
Rbfox3Q8BIF2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Rbfox3Q8BIF2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Rbfox3Q8BIF2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Rbfox3Q8BIF2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Rbfox3Q8BIF2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Rbfox3Q8BIF2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Rbfox3Q8BIF2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Rbfox3Q8BIF2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,08■■□□□ 1,12
Rbfox3Q8BIF2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Rbfox3Q8BIF2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Rbfox3Q8BIF2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Rbfox3Q8BIF2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Rbfox3Q8BIF2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Rbfox3Q8BIF2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Rbfox3Q8BIF2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Rbfox3Q8BIF2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
Rbfox3Q8BIF2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Rbfox3Q8BIF2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Rbfox3Q8BIF2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Rbfox3Q8BIF2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Rbfox3Q8BIF2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Rbfox3Q8BIF2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Rbfox3Q8BIF2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Rbfox3Q8BIF2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Rbfox3Q8BIF2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,69■■□□□ 1,06
Rbfox3Q8BIF2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Rbfox3Q8BIF2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Rbfox3Q8BIF2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Rbfox3Q8BIF2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rbfox3Q8BIF2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,55■■□□□ 1,04
Rbfox3Q8BIF2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Rbfox3Q8BIF2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Rbfox3Q8BIF2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rbfox3Q8BIF2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rbfox3Q8BIF2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Rbfox3Q8BIF2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Rbfox3Q8BIF2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Rbfox3Q8BIF2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Rbfox3Q8BIF2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,41■■□□□ 1,02
Rbfox3Q8BIF2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Rbfox3Q8BIF2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,39■■□□□ 1,01
Rbfox3Q8BIF2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Rbfox3Q8BIF2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Rbfox3Q8BIF2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Rbfox3Q8BIF2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Rbfox3Q8BIF2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Rbfox3Q8BIF2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Rbfox3Q8BIF2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Rbfox3Q8BIF2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Rbfox3Q8BIF2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Rbfox3Q8BIF2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Rbfox3Q8BIF2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Rbfox3Q8BIF2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Rbfox3Q8BIF2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Rbfox3Q8BIF2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rbfox3Q8BIF2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Rbfox3Q8BIF2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Rbfox3Q8BIF2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Rbfox3Q8BIF2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Rbfox3Q8BIF2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Rbfox3Q8BIF2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Rbfox3Q8BIF2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Rbfox3Q8BIF2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Rbfox3Q8BIF2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rbfox3Q8BIF2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rbfox3Q8BIF2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
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