Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rbfox3Q8BIF2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbfox3Q8BIF2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbfox3Q8BIF2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbfox3Q8BIF2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbfox3Q8BIF2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbfox3Q8BIF2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbfox3Q8BIF2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbfox3Q8BIF2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbfox3Q8BIF2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbfox3Q8BIF2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbfox3Q8BIF2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbfox3Q8BIF2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbfox3Q8BIF2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbfox3Q8BIF2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbfox3Q8BIF2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbfox3Q8BIF2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbfox3Q8BIF2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbfox3Q8BIF2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbfox3Q8BIF2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbfox3Q8BIF2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbfox3Q8BIF2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbfox3Q8BIF2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbfox3Q8BIF2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbfox3Q8BIF2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbfox3Q8BIF2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbfox3Q8BIF2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbfox3Q8BIF2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbfox3Q8BIF2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbfox3Q8BIF2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbfox3Q8BIF2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbfox3Q8BIF2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbfox3Q8BIF2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbfox3Q8BIF2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbfox3Q8BIF2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbfox3Q8BIF2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbfox3Q8BIF2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbfox3Q8BIF2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbfox3Q8BIF2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbfox3Q8BIF2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbfox3Q8BIF2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbfox3Q8BIF2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbfox3Q8BIF2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbfox3Q8BIF2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbfox3Q8BIF2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbfox3Q8BIF2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbfox3Q8BIF2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbfox3Q8BIF2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbfox3Q8BIF2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbfox3Q8BIF2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbfox3Q8BIF2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbfox3Q8BIF2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbfox3Q8BIF2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbfox3Q8BIF2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbfox3Q8BIF2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbfox3Q8BIF2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbfox3Q8BIF2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbfox3Q8BIF2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbfox3Q8BIF2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbfox3Q8BIF2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbfox3Q8BIF2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbfox3Q8BIF2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbfox3Q8BIF2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbfox3Q8BIF2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbfox3Q8BIF2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbfox3Q8BIF2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbfox3Q8BIF2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbfox3Q8BIF2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbfox3Q8BIF2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbfox3Q8BIF2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbfox3Q8BIF2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbfox3Q8BIF2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbfox3Q8BIF2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbfox3Q8BIF2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbfox3Q8BIF2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbfox3Q8BIF2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbfox3Q8BIF2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbfox3Q8BIF2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbfox3Q8BIF2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbfox3Q8BIF2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbfox3Q8BIF2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbfox3Q8BIF2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbfox3Q8BIF2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbfox3Q8BIF2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbfox3Q8BIF2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbfox3Q8BIF2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbfox3Q8BIF2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbfox3Q8BIF2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbfox3Q8BIF2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbfox3Q8BIF2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbfox3Q8BIF2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbfox3Q8BIF2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbfox3Q8BIF2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbfox3Q8BIF2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbfox3Q8BIF2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbfox3Q8BIF2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbfox3Q8BIF2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbfox3Q8BIF2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbfox3Q8BIF2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbfox3Q8BIF2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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