RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	MAL33	P38157	468 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	PSY4	P38193	441 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	BCD1	P38772	366 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	PPE1	P38796	400 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	MBP1	P39678	833 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	CIR1	P42940	261 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	EPL1	P43572	832 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	RET2	P43621	546 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	NCS6	P53088	359 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	SLD3	P53135	668 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	YGR117C	P53270	476 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	SCM3	Q12334	223 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	CEX1	Q12453	761 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	FLO11	P08640	1367 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	RDS1	P25611	832 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	YPT53	P36019	220 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	YBR284W	P38150	797 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	CST26	P38226	397 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	RXT2	P38255	430 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	POP2	P39008	433 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	MEP1	P40260	492 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	MET13	P53128	600 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	SDH5	Q08230	162 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	TOP3	P13099	656 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	KAR4	P25583	335 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	AAD3	P25612	363 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	PCL2	P25693	308 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	DBF4	P32325	704 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	BEM3	P32873	1128 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	YBL028C	P38202	106 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	BIT2	P38346	545 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	BNA1	P47096	177 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	BFA1	P47113	574 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	YGR153W	P48238	217 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	ZIP2	P53061	704 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	RTC4	P53850	401 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	HDA1	P53973	706 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	VTI1	Q04338	217 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	PEX15	Q08215	383 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRP4	YHL004W	STF1	P01098	86 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CDC9	P04819	755 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	NUC1	P08466	329 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MSH1	P25846	959 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SPC29	P33419	253 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	DID4	P36108	232 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MOH1	P38191	138 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	UBS1	P38290	277 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	VPS45	P38932	577 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	JEM1	P40358	645 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CSM2	P40465	213 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	PCI8	P40512	444 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	BUL1	P48524	976 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	VPS4	P52917	437 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	NPY1	P53164	384 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MEP3	P53390	489 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	NSE5	Q03718	556 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	DSE3	Q08729	430 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	TIP41	Q12199	356 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CBP1	P07252	654 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MBR1	P23493	339 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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