RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	HRD3	Q05787	833 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	MLH2	Q07980	695 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	TCO89	Q08921	799 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	GAL4	P04386	881 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	CHS2	P14180	963 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	MRPL40	P36534	297 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	PSY2	P40164	858 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	UBP7	P40453	1071 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	AQR1	P53943	586 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	PIR3	Q03180	325 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YMR206W	Q03695	313 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	NDD1	Q08887	554 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YPL150W	Q12152	901 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	MED1	Q12321	566 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RIP1	P08067	215 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	STE4	P18851	423 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	CDC42	P19073	191 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	ASG1	P40467	964 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SUN4	P53616	420 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YFT2	Q06676	274 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	PSR2	Q07949	397 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	OPI10	Q08202	246 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RSB1	Q08417	382 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SLX4	Q12098	748 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SUL2	Q12325	893 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	KAE1	P36132	386 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	EXO1	P39875	702 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	HXT8	P40886	569 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	PFD1	P46988	109 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	MEC1	P38111	2368 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	BRF1	P29056	596 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	CBF2	P32504	956 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	MAL33	P38157	468 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YBR053C	P38235	358 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YHR078W	P38799	552 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	AIM23	P47015	356 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	TRE1	Q08919	783 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YLR122C	Q12312	125 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SEC63	P14906	663 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SEC15	P22224	910 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	HIR1	P32479	840 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YKR073C	P36153	106 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SER33	P40510	469 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	CPR7	P47103	393 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SWS2	P53937	143 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	TRM82	Q03774	444 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	PNP1	Q05788	311 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	PMT7	Q06644	662 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	APC5	Q08683	685 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YOR389W	Q08912	624 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	YPL278C	Q08990	100 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SVS1	Q12254	260 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RKM5	Q12367	367 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	TRP3	P00937	484 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	AIM46	P38885	310 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	FET5	P43561	622 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	RSC1	P53236	928 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	MED7	Q08278	222 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	VPS54	Q12071	889 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	PER33	Q12144	273 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	RRN6	P32786	894 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	TFA2	P36145	328 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	DSN1	P40568	576 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	ASG7	P46993	209 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	MND1	P53102	219 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YGL140C	P53120	1219 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44

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