RNA–Protein interactions for RNA: YKR033C

YKR033C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR033C, Length 426 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR033CYKR033C MDR1P53258 950 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C SDA1P53313 767 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C MAL13P53338 473 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C CBK1P53894 756 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C WAR1Q03631 944 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C PHM6Q05637 104 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C EAF1Q06337 982 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C YLH47Q06493 454 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C GUP2Q08929 609 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C TOP1P04786 769 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C SWI6P09959 803 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C PCK1P10963 549 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C TCP1P12612 559 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C PRP9P19736 530 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C SRP54P20424 541 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C SPO11P23179 398 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C RPC53P25441 422 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C MRC1P25588 1096 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C CDC60P26637 1090 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C CDC15P27636 974 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C CHS3P29465 1165 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C MCM4P30665 933 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C PRO3P32263 286 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C SRB4P32569 687 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C BYE1P36106 594 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C CTF8P38877 133 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C HMF1P40037 129 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C SDS3P40505 327 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C CEP3P40969 608 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C NET1P47035 1189 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data3.04□□□□□ -1.92not detected
YKR033CYKR033C CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C UBA2P52488 636 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C SHE10P53075 577 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C LIF1P53150 421 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C YKR011CQ02209 353 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C ERV41Q04651 352 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C YLR287CQ05881 355 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C VPS38Q05919 439 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C TSR1Q07381 788 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C YLR040CQ07988 224 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C MED1Q12321 566 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C CSR2Q12734 1121 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C NUM1Q00402 2748 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C VPS13Q07878 3144 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C PGK1P00560 416 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C TUF1P02992 437 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
YKR033CYKR033C HPR1P17629 752 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C SED4P25365 1065 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C YCL002CP25565 263 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C ARE1P25628 610 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C DPB3P27344 201 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C CNS1P33313 385 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C BUD2P33314 1104 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C UBP13P38187 747 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C RSP5P39940 809 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C BUD16P39988 312 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C PEA2P40091 420 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C NDC80P40460 691 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C YIL108WP40483 696 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C GYP8P43570 497 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C UBP6P43593 499 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C FMS1P50264 508 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C ASE1P50275 885 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C ZPR1P53303 486 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C TRM44Q02648 567 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C EBS1Q03466 884 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C SMD2Q06217 110 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C SPO75Q07798 868 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C RLP24Q07915 199 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C FLC1Q08967 793 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C GIN4Q12263 1142 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR033CYKR033C FLO11P08640 1367 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C YLR278CQ05854 1341 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C RPP2AP05319 106 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C SNF1P06782 633 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C TRP4P07285 380 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C SRD1P09007 221 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C RAD18P10862 487 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C CKI1P20485 582 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C VPS1P21576 704 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C CAD1P24813 409 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C EFT1P32324 842 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C SUL1P38359 859 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C GAA1P39012 614 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C SPC72P39723 622 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C ACA1P39970 489 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C VFA1P40080 203 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C AIP1P46680 615 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C TIM54P47045 478 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C ERP6P53198 216 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR033CYKR033C YGR125WP53273 1036 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 85 ms