RNA–Protein interactions for RNA: YKR033C

YKR033C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR033C, Length 426 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR033CYKR033C MTC1P47018 478 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
YKR033CYKR033C DRS1P32892 752 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YKR033CYKR033C FAP1P53971 965 aa7.71□□□□□ -1.18
YKR033CYKR033C PRI1P10363 409 aa7.42□□□□□ -1.22
YKR033CYKR033C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
YKR033CYKR033C AAD16Q02895 342 aa7.31□□□□□ -1.24
YKR033CYKR033C ISW2Q08773 1120 aa7.27□□□□□ -1.25
YKR033CYKR033C RPG1P38249 964 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YKR033CYKR033C PRY3P47033 881 aa7.26□□□□□ -1.25
YKR033CYKR033C AVT3P36062 692 aa7.24□□□□□ -1.25
YKR033CYKR033C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
YKR033CYKR033C YCK3P39962 524 aa7.07□□□□□ -1.28
YKR033CYKR033C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YKR033CYKR033C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YKR033CYKR033C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
YKR033CYKR033C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
YKR033CYKR033C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
YKR033CYKR033C REB1P21538 810 aa6.74□□□□□ -1.33
YKR033CYKR033C MRPL32P25348 183 aa6.67□□□□□ -1.34
YKR033CYKR033C SPT21P35209 758 aa6.64□□□□□ -1.35
YKR033CYKR033C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
YKR033CYKR033C TFA1P36100 482 aa6.49□□□□□ -1.37
YKR033CYKR033C CDC27P38042 758 aa6.49□□□□□ -1.37
YKR033CYKR033C RIM101P33400 625 aa6.45□□□□□ -1.38
YKR033CYKR033C TFC8Q12308 588 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR033CYKR033C HOP09932 586 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR033CYKR033C YGL015CP33199 130 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR033CYKR033C DCD1P06773 312 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR033CYKR033C OXP1P28273 1286 aa6.28□□□□□ -1.4
YKR033CYKR033C MAP2P38174 421 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
YKR033CYKR033C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
YKR033CYKR033C BCH2P36122 765 aa6.17□□□□□ -1.42
YKR033CYKR033C SCY1P53009 804 aa6.11□□□□□ -1.43
YKR033CYKR033C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
YKR033CYKR033C PTP3P40048 928 aa6.02□□□□□ -1.45
YKR033CYKR033C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
YKR033CYKR033C EPS1P40557 701 aa6□□□□□ -1.45
YKR033CYKR033C RSM7P47150 247 aa6□□□□□ -1.45
YKR033CYKR033C SLX5P32828 619 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
YKR033CYKR033C BDF1P35817 686 aa5.99□□□□□ -1.45
YKR033CYKR033C YLR271WQ06152 274 aa5.99□□□□□ -1.45
YKR033CYKR033C AI2P03876 854 aa5.93□□□□□ -1.46
YKR033CYKR033C SSP1P38871 571 aa5.93□□□□□ -1.46
YKR033CYKR033C TGL3P40308 642 aa5.9□□□□□ -1.46
YKR033CYKR033C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YKR033CYKR033C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YKR033CYKR033C BBC1P47068 1157 aa5.84□□□□□ -1.47
YKR033CYKR033C CST9Q06032 482 aa5.8□□□□□ -1.48
YKR033CYKR033C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data5.77□□□□□ -1.49not detected
YKR033CYKR033C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
YKR033CYKR033C MST1P07236 462 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR033CYKR033C MRM1P25270 412 aa5.73□□□□□ -1.49
YKR033CYKR033C MGA2P40578 1113 aa5.73□□□□□ -1.49
YKR033CYKR033C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data5.71□□□□□ -1.5not detected
YKR033CYKR033C VPS29P38759 282 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR033CYKR033C YOR238WQ08634 303 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR033CYKR033C RCR1P38212 213 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR033CYKR033C YAP5P40574 245 aa5.64□□□□□ -1.51
YKR033CYKR033C RTG3P38165 486 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR033CYKR033C PIB1Q06651 286 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR033CYKR033C UBP9P39967 754 aa5.58□□□□□ -1.52
YKR033CYKR033C STS1P38637 319 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR033CYKR033C YBL029C-AQ3E756 94 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR033CYKR033C DBP1P24784 617 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YKR033CYKR033C YFR006WP43590 535 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR033CYKR033C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data5.55□□□□□ -1.52not detected
YKR033CYKR033C VNX1P42839 908 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR033CYKR033C RAM2P29703 316 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR033CYKR033C WSC3Q12215 556 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR033CYKR033C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YKR033CYKR033C GTT3P39996 337 aa5.46□□□□□ -1.54
YKR033CYKR033C SAM3Q08986 587 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR033CYKR033C SIS1P25294 352 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YKR033CYKR033C TIF11P38912 153 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
YKR033CYKR033C YOL036WQ08206 761 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR033CYKR033C MAK11P20484 414 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
YKR033CYKR033C EDS1P38073 919 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR033CYKR033C SPP1Q03012 353 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR033CYKR033C IOC2Q12072 812 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR033CYKR033C SET4P42948 560 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR033CYKR033C ULI1P43604 169 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR033CYKR033C MSB4Q12317 492 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR033CYKR033C TRP5P00931 707 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
YKR033CYKR033C COQ8P27697 501 aa5.36□□□□□ -1.55
YKR033CYKR033C PTC3P34221 468 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YKR033CYKR033C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YKR033CYKR033C MIF2P35201 549 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR033CYKR033C FKH1P40466 484 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR033CYKR033C GYP5Q12344 894 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR033CYKR033C LDB19Q12502 818 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR033CYKR033C EAP1P36041 632 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YKR033CYKR033C DCW1P36091 449 aa5.31□□□□□ -1.56
YKR033CYKR033C NST1P53935 1240 aa5.31□□□□□ -1.56
YKR033CYKR033C SOL3P38858 249 aa5.3□□□□□ -1.56
YKR033CYKR033C DAN4P47179 1161 aa5.29□□□□□ -1.56
YKR033CYKR033C RTG1P32607 177 aa5.27□□□□□ -1.57
YKR033CYKR033C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YKR033CYKR033C HTA1P04911 132 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YKR033CYKR033C HTA2P04912 132 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR033CYKR033C ABP1P15891 592 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms