RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.63	□□□□□ -1.51	not detected
YMD8	YML038C	PET111	P08468	800 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	PET123	P17558	318 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	MSH1	P25846	959 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	TFB1	P32776	642 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	MDL1	P33310	695 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	RPC37	P36121	282 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	CCL1	P37366	393 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	YHR131C	P38835	850 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	GCD10	P41814	478 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	CIR1	P42940	261 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	POL31	P46957	487 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	MDE1	P47095	244 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	CIA1	Q05583	330 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	MLH2	Q07980	695 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	YOR223W	Q12015	292 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ISA2	Q12425	185 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	YIL177C	P40434	1758 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	YJL225C	P40889	1758 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SEM1	O94742	89 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	MCD4	P36051	919 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	YLF2	P38746	405 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	PPE1	P38796	400 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	KHA1	P40309	873 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	RIC1	P40395	1056 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SMK1	P41808	388 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	YGR153W	P48238	217 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	CIK1	Q01649	594 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ADA2	Q02336	434 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	HOT1	Q03213	719 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	FCP1	Q03254	732 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SIR4	P11978	1358 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.61	□□□□□ -1.51	not detected
YMD8	YML038C	MNE1	P24720	663 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	YKU70	P32807	602 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	XRS2	P33301	854 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.61	□□□□□ -1.51	not detected
YMD8	YML038C	DID4	P36108	232 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	KAE1	P36132	386 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	CCZ1	P38273	704 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SAF1	P38352	637 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	AKR1	P39010	764 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	YJL068C	P40363	299 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	UBP7	P40453	1071 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	MPH1	P40562	993 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ALG2	P43636	503 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	MAD3	P47074	515 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	PEX25	Q02969	394 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	COG8	Q04632	607 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ARP9	Q05123	467 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	NFI1	Q12216	726 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	BI4	P03879	638 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ENA1	P13587	1091 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	CHS2	P14180	963 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	MRPL25	P23369	157 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	AFG2	P32794	780 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ATG19	P35193	415 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ALG3	P38179	458 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	HSM3	P38348	480 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	CIT3	P43635	486 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	YJL055W	P47044	245 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	HNT2	P49775	206 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	RMT2	Q03305	412 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SKY1	Q03656	742 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	YMR155W	Q03795	547 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	YPR027C	Q12079	277 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	PTC5	Q12511	572 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	NTG1	P31378	399 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	SMI1	P32566	505 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YMD8	YML038C	VPS45	P38932	577 aa		5.59	□□□□□ -1.51

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