RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C CBF2P32504 956 aa7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C GIP1P38229 639 aa7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C PCF11P39081 626 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C HEM14P40012 539 aa7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C OSW5P40219 148 aa7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C AIP1P46680 615 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C YGR237CP50089 785 aa7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C MND1P53102 219 aa7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C HRD3Q05787 833 aa7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C DDC1Q08949 612 aa7.4□□□□□ -1.22
SPE3YPR069C UBR1P19812 1950 aa7.4□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C PSO2P30620 661 aa7.39□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C STE5P32917 917 aa7.39□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C EFM2P38347 419 aa7.39□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C SSP1P38871 571 aa7.39□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C YNR065CP53751 1116 aa7.39□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C YLR297WQ05899 129 aa7.39□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C CSR1Q06705 408 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C VPS54Q12071 889 aa7.39□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C PCT1P13259 424 aa7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C APL1P27351 700 aa7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C CSG2P35206 410 aa7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C TCD2P36101 447 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C YER130CP39959 443 aa7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C CCT5P40413 562 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C RSM25P40496 264 aa7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C PFD1P46988 109 aa7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C DAN4P47179 1161 aa7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C RSC1P53236 928 aa7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C TDA7P53882 636 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C RTN1Q04947 295 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C YOR387CQ08910 206 aa7.38□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C CSF1Q12150 2958 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C ENO2P00925 437 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C GPA1P08539 472 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C XRS2P33301 854 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C SGE1P33335 543 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C RIM101P33400 625 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C DYS1P38791 387 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C DUN1P39009 513 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C GIP4P39732 760 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C UFE1P41834 346 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C NUP84P52891 726 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C DRN1P53255 507 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C KRE33P53914 1056 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data7.37□□□□□ -1.23not detected
SPE3YPR069C PIR3Q03180 325 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C EAF1Q06337 982 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C YAP7Q08182 245 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C AFT2Q08957 416 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C SPO21Q12411 609 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C STB3Q12427 513 aa7.37□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C CCP1P00431 361 aa7.36□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C DAL2P25335 343 aa7.36□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C YBR053CP38235 358 aa7.36□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C FAA3P39002 694 aa7.36□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C GDH3P39708 457 aa7.36□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C FLC3P53121 802 aa7.36□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C COQ6P53318 479 aa7.36□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C HFA1P32874 2273 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C PPR1P07272 904 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C MSF1P08425 469 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C KEX1P09620 729 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C YER152CP10356 443 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C YPT35P38815 214 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C PIK1P39104 1066 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C SDS3P40505 327 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C ASG7P46993 209 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C VTC4P47075 721 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C HFM1P51979 1187 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C EBS1Q03466 884 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C ARO80Q04052 950 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C AIM32Q04689 311 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C TAF9Q05027 157 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C PMT7Q06644 662 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C MDM38Q08179 573 aa7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C JIP3O13555 125 aa7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C BI4P03879 638 aa7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C RPS3P05750 240 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C AEP2P22136 580 aa7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C GUT1P32190 709 aa7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C MRP4P32902 394 aa7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C PRK1P40494 810 aa7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C CIR1P42940 261 aa7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C PUS2P53167 370 aa7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C GPD1Q00055 391 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C ETT1Q08421 412 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C SVS1Q12254 260 aa7.34□□□□□ -1.23
SPE3YPR069C MRC1P25588 1096 aa7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C TFB1P32776 642 aa7.33□□□□□ -1.24
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