RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YPR027C	Q12079	277 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	BUG1	Q12191	341 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	KCS1	Q12494	1050 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ENA5	Q12691	1091 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	HVG1	P0CE11	249 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YML002W	P0CF17	737 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TOP3	P13099	656 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PCL2	P25693	308 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MSP1	P28737	362 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	IRE1	P32361	1115 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MEI5	P32489	222 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	UGA4	P32837	571 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YEL1	P34225	687 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	UME6	P39001	836 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	LYS14	P40971	790 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SMC3	P47037	1230 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SGF73	P53165	657 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ULP1	Q02724	621 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	NNT1	Q05874	261 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	LOT6	Q07923	191 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YOR238W	Q08634	303 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TY3A-G	Q12173	290 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ARP7	Q12406	477 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TY3A-I	Q99219	290 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SGS1	P35187	1447 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.49	□□□□□ -1.85	not detected
SET1	YHR119W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PTR2	P32901	601 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MIA40	P36046	403 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	DID4	P36108	232 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CDC27	P38042	758 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	LAM1	P38851	1228 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	NPR2	P39923	615 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ALG2	P43636	503 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ASK10	P48361	1146 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MSN5	P52918	1224 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SKY1	Q03656	742 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	GIS4	Q04233	774 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MGR3	Q04472	501 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	DON1	Q05610	365 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	HER1	Q12276	1246 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	GYP5	Q12344	894 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SKS1	Q12505	502 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	GCN4	P03069	281 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YBR284W	P38150	797 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YHL017W	P38745	532 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PIK1	P39104	1066 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YIL089W	P40500	205 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	FIG4	P42837	879 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SNF12	P53628	566 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SPP1	Q03012	353 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	VPS20	Q04272	221 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	LCD1	Q04377	747 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CAB1	Q04430	367 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YPL277C	Q08989	487 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	HAL9	Q12180	1030 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RBD2	Q12270	262 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TPK1	P06244	397 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	FBP1	P09201	348 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	BOS1	P25385	244 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CWH43	P25618	953 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MSN4	P33749	630 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MSR1	P38714	643 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MTW1	P39731	289 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SSU1	P41930	458 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	APL6	P46682	809 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	BNA2	P47125	453 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CUL3	P53202	744 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SSL2	Q00578	843 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	VID22	Q05934	901 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	DCS2	Q12123	353 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PCD1	Q12524	340 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	KEX2	P13134	814 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ADK2	P26364	225 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SQT1	P35184	431 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	GPT2	P36148	743 aa		3.48	□□□□□ -1.85

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