RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MUB1	Q03162	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PRM15	Q03262	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MSC3	Q05812	728 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	CDC45	Q08032	650 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	UAF30	Q08747	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	CTT1	P06115	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	ATP11	P32453	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	DOA4	P32571	926 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MSS2	P40990	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	CUL3	P53202	744 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YAP7	Q08182	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MPD2	Q99316	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	DIT1	P21623	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	NPL4	P33755	580 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	GAL1	P04385	528 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SEN34	P39707	275 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	NMD5	P46970	1048 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YJL055W	P47044	245 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	VPS75	P53853	264 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PDR8	Q06149	701 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	NSE1	Q07913	336 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MSH5	Q12175	901 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	AVL9	Q12500	764 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	DST1	P07273	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ITR1	P30605	584 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	CTF13	P35203	478 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	COS8	P38723	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	UFO1	Q04511	668 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	AIM32	Q04689	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MSB4	Q12317	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	EDE1	P34216	1381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	GPA1	P08539	472 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	TFB1	P32776	642 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PET112	P33893	541 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MSG5	P38590	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MNN1	P39106	762 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	POL32	P47110	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	INP2	Q03824	705 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	STF1	P01098	86 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	CNA1	P23287	553 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	BZZ1	P38822	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YDR089W	P38966	869 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	VPS8	P39702	1274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	GNP1	P48813	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ATF2	P53296	535 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	TBF1	Q02457	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YML131W	Q03102	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	VPS20	Q04272	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ISN1	Q99312	450 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PRC1	P00729	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	COS111	P38308	924 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	FET4	P40988	552 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YGR042W	P53227	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	DAM1	P53267	343 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SIW14	P53965	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ATC1	Q04005	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	TLG2	Q08144	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YBL010C	P32788	280 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	VPS29	P38759	282 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	OTU1	P43558	301 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SSN8	P47821	323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	TRE2	Q08693	809 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	NBP2	Q12163	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	APL1	P27351	700 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	OCT1	P35999	772 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SET3	P36124	751 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	NUP133	P36161	1157 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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