RNA–Protein interactions for RNA: YKL113C

RAD27, Transcript of 5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease, yeast

Gene RAD27, Length 1,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD27	YKL113C	PUP1	P25043	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	VAC17	P25591	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	KIP1	P28742	1111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	COT1	P32798	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	PEP12	P32854	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	VPS35	P34110	944 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	PEX5	P35056	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	OCT1	P35999	772 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	VAB2	P40003	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	KEL2	P50090	882 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	YGR035C	P53222	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	MRS2	Q01926	470 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	RNT1	Q02555	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	STE23	Q06010	1027 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	PSR1	Q07800	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	HAP4	P14064	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	KIP2	P28743	706 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	ATG19	P35193	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	YKR018C	P36114	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	RPC37	P36121	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	TVP38	P36164	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	RGD1	P38339	666 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	RCK2	P38623	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	GPB2	P39717	880 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	PSY2	P40164	858 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	RAD26	P40352	1085 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	YIR007W	P40566	764 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	YNL058C	P53947	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	URH1	Q04179	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	ENT2	Q05785	613 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	SFH1	Q06168	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	CRD1	Q07560	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	SPO21	Q12411	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	RKM4	Q12504	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	BRF1	P29056	596 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	ISF1	P32488	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	SEC6	P32844	805 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	SEC8	P32855	1065 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	YKL050C	P35736	922 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	MCD4	P36051	919 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	MMS21	P38632	267 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	MEP1	P40260	492 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	RPC17	P47076	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	YJR079W	P47126	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	GPI8	P49018	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	TAM41	P53230	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	JJJ1	P53863	590 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	TIM8	P57744	87 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	ROD1	Q02805	837 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	ARR1	Q06596	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	OMS1	Q06668	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD27	YKL113C	YLR462W	O13556	202 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	PHO87	P25360	923 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	EUG1	P32474	517 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	SWI3	P32591	825 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	UTR4	P32626	227 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	RRN6	P32786	894 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	IXR1	P33417	597 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	EXO5	P38289	585 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	YHL049C	P38722	271 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	YHR218W	P38899	603 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	SAK1	P38990	1142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	SPC72	P39723	622 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	YEL075C	P39972	122 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD27	YKL113C	YER189W	P40104	122 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.2 ms