RNA–Protein interactions for RNA: YOL063C

CRT10, Transcript of Protein involved in transcriptional regulation of RNR2 and RNR3, yeast

Gene CRT10, Length 2,874 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CRT10	YOL063C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CRT10	YOL063C	NMA2	P53204	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRT10	YOL063C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRT10	YOL063C	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRT10	YOL063C	DSE3	Q08729	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRT10	YOL063C	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CRT10	YOL063C	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	GCR1	P07261	785 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	HES1	P35843	434 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	VHC1	P38329	1120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	NUP82	P40368	713 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PRK1	P40494	810 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	EMP47	P43555	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CBK1	P53894	756 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	FMP30	Q02883	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	ACL4	Q03771	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	VHS3	Q08438	674 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	MED1	Q12321	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CLB2	P24869	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SAS3	P34218	831 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YKL133C	P36066	463 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	RRT2	P38332	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	HIS2	P38635	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	IES2	P40154	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CAB2	P40506	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	THI12	P42883	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	THI5	P43534	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	THI11	P47183	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	COS5	P47187	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	USE1	P53146	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	TFB3	Q03290	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	FMP42	Q04991	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	THI13	Q07748	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
CRT10	YOL063C	ACM1	Q08981	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
CRT10	YOL063C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CBF1	P17106	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
CRT10	YOL063C	BUD2	P33314	1104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YKL050C	P35736	922 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	TSC10	P38342	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	MSG5	P38590	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	IES5	P40060	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	STB2	P46679	850 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	DSE4	P53753	1117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	ATG16	Q03818	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SWI6	P09959	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YIR042C	P40586	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YGL108C	P53139	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CSM3	Q04659	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	FUS2	Q05670	677 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SFL1	P20134	766 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	ADY2	P25613	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SEC6	P32844	805 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PEX18	P38855	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CIK1	Q01649	594 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	THI3	Q07471	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SCM3	Q12334	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	ATR1	P13090	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CNA1	P23287	553 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CSE1	P33307	960 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
CRT10	YOL063C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	IRR1	P40541	1150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	MUB1	Q03162	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	GGA1	Q06336	557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CLN1	P20437	546 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	BRF1	P29056	596 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	MGM1	P32266	881 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PES4	P39684	611 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SAD1	P43589	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	RFX1	P48743	811 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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