Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 NSR1YGR159C 1245 nt20.65■□□□□ 0.9
VHS3Q08438 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.36■□□□□ 0.85
VHS3Q08438 NOP1YDL014W 984 nt19.73■□□□□ 0.75
VHS3Q08438 MDJ1YFL016C 1536 nt18.59■□□□□ 0.57
VHS3Q08438 YKL036CYKL036C 393 nt17.79■□□□□ 0.44
VHS3Q08438 YJL027CYJL027C 417 nt17.2■□□□□ 0.34
VHS3Q08438 SRX1YKL086W 384 nt17.2■□□□□ 0.34
VHS3Q08438 Q0297Q0297 156 nt17.11■□□□□ 0.33
VHS3Q08438 DBP2YNL112W 1641 nt16.29■□□□□ 0.2
VHS3Q08438 YCR051WYCR051W 669 nt16.25■□□□□ 0.19
VHS3Q08438 YBR190WYBR190W 312 nt16.05■□□□□ 0.16
VHS3Q08438 SCS3YGL126W 1143 nt15.93■□□□□ 0.14
VHS3Q08438 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.75■□□□□ 0.11
VHS3Q08438 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.75■□□□□ 0.11
VHS3Q08438 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.75■□□□□ 0.11
VHS3Q08438 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.75■□□□□ 0.11
VHS3Q08438 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.75■□□□□ 0.11
VHS3Q08438 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.75■□□□□ 0.11
VHS3Q08438 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.75■□□□□ 0.11
VHS3Q08438 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.75■□□□□ 0.11
VHS3Q08438 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.75■□□□□ 0.11
VHS3Q08438 RTC3YHR087W 336 nt15.64■□□□□ 0.09
VHS3Q08438 CCC1YLR220W 969 nt15.56■□□□□ 0.08
VHS3Q08438 YOL085CYOL085C 342 nt15.4■□□□□ 0.06
VHS3Q08438 RPP1BYDL130W 321 nt15.35■□□□□ 0.05
VHS3Q08438 RVS167YDR388W 1449 nt15.34■□□□□ 0.05
VHS3Q08438 PKP1YIL042C 1185 nt15.15■□□□□ 0.02
VHS3Q08438 SCJ1YMR214W 1134 nt15.05■□□□□ -0
VHS3Q08438 PUT4YOR348C 1884 nt14.8□□□□□ -0.04
VHS3Q08438 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.78□□□□□ -0.04
VHS3Q08438 SSA3YBL075C 1950 nt14.73□□□□□ -0.05
VHS3Q08438 SHR5YOL110W 714 nt14.68□□□□□ -0.06
VHS3Q08438 PET122YER153C 765 nt14.65□□□□□ -0.06
VHS3Q08438 URN1YPR152C 1398 nt14.48□□□□□ -0.09
VHS3Q08438 SCR1SCR1 522 nt14.47□□□□□ -0.09
VHS3Q08438 ARE1YCR048W 1833 nt14.4□□□□□ -0.1
VHS3Q08438 OPI9YLR338W 858 nt14.38□□□□□ -0.11
VHS3Q08438 YDJ1YNL064C 1230 nt14.34□□□□□ -0.11
VHS3Q08438 SAH1YER043C 1350 nt14.34□□□□□ -0.11
VHS3Q08438 DEP1YAL013W 1218 nt14.32□□□□□ -0.12
VHS3Q08438 POA1YBR022W 534 nt14.31□□□□□ -0.12
VHS3Q08438 RPN10YHR200W 807 nt14.26□□□□□ -0.13
VHS3Q08438 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.23□□□□□ -0.13
VHS3Q08438 RRN5YLR141W 1092 nt14.21□□□□□ -0.13
VHS3Q08438 ATS1YAL020C 1002 nt14.17□□□□□ -0.14
VHS3Q08438 YNL208WYNL208W 600 nt14.14□□□□□ -0.15
VHS3Q08438 BSC6YOL137W 1494 nt14.07□□□□□ -0.16
VHS3Q08438 GAR1YHR089C 618 nt14.02□□□□□ -0.17
VHS3Q08438 PUN1YLR414C 792 nt13.99□□□□□ -0.17
VHS3Q08438 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.92□□□□□ -0.18
VHS3Q08438 BUD23YCR047C 828 nt13.88□□□□□ -0.19
VHS3Q08438 PTC2YER089C 1395 nt13.83□□□□□ -0.2
VHS3Q08438 YJR018WYJR018W 363 nt13.81□□□□□ -0.2
VHS3Q08438 RSB1YOR049C 1065 nt13.8□□□□□ -0.2
VHS3Q08438 NAB2YGL122C 1578 nt13.75□□□□□ -0.21
VHS3Q08438 SPT5YML010W 3192 nt13.67□□□□□ -0.22
VHS3Q08438 TIR1YER011W 765 nt13.59□□□□□ -0.23
VHS3Q08438 DAL1YIR027C 1383 nt13.47□□□□□ -0.25
VHS3Q08438 RPP2BYDR382W 333 nt13.47□□□□□ -0.25
VHS3Q08438 SSA1YAL005C 1929 nt13.47□□□□□ -0.25
VHS3Q08438 FIS1YIL065C 468 nt13.44□□□□□ -0.26
VHS3Q08438 YJR120WYJR120W 351 nt13.43□□□□□ -0.26
VHS3Q08438 INM2YDR287W 879 nt13.42□□□□□ -0.26
VHS3Q08438 FPR4YLR449W 1179 nt13.4□□□□□ -0.26
VHS3Q08438 SSA4YER103W 1929 nt13.39□□□□□ -0.27
VHS3Q08438 PHO4YFR034C 939 nt13.32□□□□□ -0.28
VHS3Q08438 MEP2YNL142W 1500 nt13.28□□□□□ -0.28
VHS3Q08438 Q0182Q0182 405 nt13.21□□□□□ -0.29
VHS3Q08438 YPS1YLR120C 1710 nt13.2□□□□□ -0.3
VHS3Q08438 PST2YDR032C 597 nt13.19□□□□□ -0.3
VHS3Q08438 YBL100CYBL100C 315 nt13.17□□□□□ -0.3
VHS3Q08438 BDH2YAL061W 1254 nt13.11□□□□□ -0.31
VHS3Q08438 SRB2YHR041C 633 nt13.09□□□□□ -0.31
VHS3Q08438 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.09□□□□□ -0.31
VHS3Q08438 YDR095CYDR095C 411 nt13.07□□□□□ -0.32
VHS3Q08438 FUN26YAL022C 1554 nt13□□□□□ -0.33
VHS3Q08438 DCW1YKL046C 1350 nt13□□□□□ -0.33
VHS3Q08438 TRM9YML014W 840 nt12.94□□□□□ -0.34
VHS3Q08438 ALF1YNL148C 765 nt12.92□□□□□ -0.34
VHS3Q08438 LSM3YLR438C-A 270 nt12.91□□□□□ -0.34
VHS3Q08438 YMR090WYMR090W 684 nt12.9□□□□□ -0.34
VHS3Q08438 WWM1YFL010C 636 nt12.89□□□□□ -0.35
VHS3Q08438 BDF1YLR399C 2061 nt12.88□□□□□ -0.35
VHS3Q08438 EMI2YDR516C 1503 nt12.88□□□□□ -0.35
VHS3Q08438 RPP2AYOL039W 321 nt12.84□□□□□ -0.35
VHS3Q08438 CCT6YDR188W 1641 nt12.81□□□□□ -0.36
VHS3Q08438 PTP1YDL230W 1008 nt12.78□□□□□ -0.36
VHS3Q08438 YGR021WYGR021W 873 nt12.78□□□□□ -0.36
VHS3Q08438 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.78□□□□□ -0.36
VHS3Q08438 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.78□□□□□ -0.36
VHS3Q08438 YDL221WYDL221W 552 nt12.76□□□□□ -0.37
VHS3Q08438 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.76□□□□□ -0.37
VHS3Q08438 YBR220CYBR220C 1683 nt12.75□□□□□ -0.37
VHS3Q08438 SIS1YNL007C 1059 nt12.73□□□□□ -0.37
VHS3Q08438 TAT1YBR069C 1860 nt12.72□□□□□ -0.37
VHS3Q08438 CAC2YML102W 1407 nt12.71□□□□□ -0.37
VHS3Q08438 SHU1YHL006C 453 nt12.71□□□□□ -0.37
VHS3Q08438 SDH1YKL148C 1923 nt12.66□□□□□ -0.38
VHS3Q08438 HOM6YJR139C 1080 nt12.66□□□□□ -0.38
VHS3Q08438 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.61□□□□□ -0.39
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