RNA–Protein interactions for RNA: YMR085W

YMR085W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YMR085W, Length 1,299 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR085W	YMR085W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	NFI1	Q12216	726 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	MDM12	Q92328	271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	ROX1	P25042	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	BUL1	P48524	976 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	UME1	Q03010	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	THI73	Q07904	523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	FBP1	P09201	348 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	TOP3	P13099	656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	VBA3	P25594	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	RPD3	P32561	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	ECM1	P39715	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
YMR085W	YMR085W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	HFD1	Q04458	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	GGA1	Q06336	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	VPS5	Q92331	675 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR085W	YMR085W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	YEL1	P34225	687 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	KTR4	P38131	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	SUL1	P38359	859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	SDP1	P40479	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	CEP3	P40969	608 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	FOL1	P53848	824 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	CLN1	P20437	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	ERG4	P25340	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	SWI3	P32591	825 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	PKH1	Q03407	766 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	COG8	Q04632	607 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	SPC29	P33419	253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	OAR1	P35731	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	NPR3	P38742	1146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	CTF8	P38877	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	TPM2	P40414	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	HDA1	P53973	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	PEX19	Q07418	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	MOH1	P38191	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	GIS1	Q03833	894 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	NDL1	Q06568	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	REH1	Q06709	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	PSR1	Q07800	427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	TRE2	Q08693	809 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	SRD1	P09007	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	RAD18	P10862	487 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	MAL11	P53048	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	ORM2	Q06144	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	NYV1	Q12255	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	GLE1	Q12315	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	SWM1	Q12379	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	TMA17	Q12513	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	KAR3	P17119	729 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	PUP2	P32379	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	CAF16	P43569	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	PUS2	P53167	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	RSC1	P53236	928 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	MEH1	Q02205	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	RNT1	Q02555	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	GUD1	Q07729	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	ENV7	Q12003	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	UFD4	P33202	1483 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YMR085W	YMR085W	CDC9	P04819	755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR085W	YMR085W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected

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