RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	NUP82	P40368	713 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	STU2	P46675	888 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	DAS1	P47005	663 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	PEP1	P32319	1579 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	SIN3	P22579	1536 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	BUD4	P47136	1447 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	MDS3	P53094	1487 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	MEF1	P25039	761 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	YBR259W	P38338	688 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	BCD1	P38772	366 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	MDM12	Q92328	271 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	VBA3	P25594	458 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	DSS1	P39112	969 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	UBC11	P52492	156 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	GAD1	Q04792	585 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	SSK2	P53599	1579 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	PHO8	P11491	566 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	MIH1	P23748	554 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	HIR1	P32479	840 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	YPT53	P36019	220 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	YHR112C	P38716	378 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	FMP52	P40008	231 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	BAP3	P41815	604 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	YFL052W	P43551	465 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	CAF16	P43569	289 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	BNA2	P47125	453 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	NPY1	P53164	384 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	YBP2	P53169	641 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	MTL1	P53214	551 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	RIA1	P53893	1110 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	ECM5	Q03214	1411 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	CIT2	P08679	460 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	YKR051W	P36142	418 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	SGO1	Q08490	590 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
PEX18	YHR160C	SUT2	Q12286	268 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	LYS9	P38999	446 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	TEL2	P53038	688 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	ORC4	P54791	529 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PEX18	YHR160C	THI4	P32318	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	ECM1	P39715	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	YML122C	Q03207	126 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	SRD1	P09007	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	GSY1	P23337	708 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	MSH2	P25847	964 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TDP1	P38319	544 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	FMO1	P38866	432 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	SSL2	Q00578	843 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	RAD18	P10862	487 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	HOG1	P32485	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	PEX6	P33760	1030 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	SFB3	P38810	929 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	NHX1	Q04121	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	KIN3	P22209	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	HSL7	P38274	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
PEX18	YHR160C	REV7	P38927	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	ARP4	P80428	489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	SIR3	P06701	978 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	NUP60	P39705	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	GET2	P40056	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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