RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	CEX1	Q12453	761 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	MDM12	Q92328	271 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	RAD16	P31244	790 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	SPC29	P33419	253 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	PEX5	P35056	612 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	EXO84	P38261	753 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	YLF2	P38746	405 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	YIR014W	P40570	242 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	SPO19	Q03029	223 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	NKP1	Q12493	238 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	ATG2	P53855	1592 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	RAD50	P12753	1312 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	PCT1	P13259	424 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	FAR1	P21268	830 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	RAD53	P22216	821 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	MND2	P40577	368 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	BFA1	P47113	574 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	YGR012W	P53206	393 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	MRPL22	P53881	309 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	CTF4	Q01454	927 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	UGO1	Q03327	502 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	APC5	Q08683	685 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	MSP1	P28737	362 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	YEL1	P34225	687 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	SEG2	P34250	1132 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	UBP13	P38187	747 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	TCD1	P38756	429 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	ECL1	P48235	211 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	SNO2	P53823	222 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	SGD1	Q06132	899 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	SAC3	P46674	1301 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	HSF1	P10961	833 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	MSM1	P22438	575 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	NFU1	P32860	256 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	PEX6	P33760	1030 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	STE13	P33894	931 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	ERC1	P38767	581 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	SHE4	P51534	789 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	DSL1	P53847	754 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	HDA1	P53973	706 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	ATP25	Q03153	612 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	ROT1	Q03691	256 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	ARO80	Q04052	950 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RIM4	YHL024W	CDC6	P09119	513 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	OPI1	P21957	404 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	MAM1	P40065	302 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	YIR042C	P40586	236 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	DAM1	P53267	343 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	VPS20	Q04272	221 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	DUS4	Q06063	367 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	SLX4	Q12098	748 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	DNF1	P32660	1571 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	ENA1	P13587	1091 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	ACP1	P32463	125 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	MUM2	P38236	366 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	MEF2	P39677	819 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	CDA2	Q06703	312 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	ADY3	Q07732	790 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	MET7	Q08645	548 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	CIR2	Q08822	631 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	PCL8	Q08966	492 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	CDC9	P04819	755 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	BUD14	P27637	709 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	MTC2	P34246	357 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	RPC37	P36121	282 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	RAD17	P48581	401 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	NIT3	P49954	291 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	TPO1	Q07824	586 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	CAT8	P39113	1433 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	NUP145	P49687	1317 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	SPE1	P08432	466 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RIM4	YHL024W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74

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