RNA–Protein interactions for RNA: YPR017C

DSS4, Transcript of Guanine nucleotide dissociation stimulator for Sec4p, yeast

Gene DSS4, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS4	YPR017C	IRC8	P47046	822 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	ENV11	P53246	860 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RSC58	Q07979	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	TOM1	Q03280	3268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	IOC3	P43596	787 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	PIP2	P52960	996 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	PIB2	P53191	635 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	YGR117C	P53270	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RIM20	Q12033	661 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	LAM4	P38800	1345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	OPI1	P21957	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	BRN1	P38170	754 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	PIK1	P39104	1066 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	SNO2	P53823	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	CBP1	P07252	654 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	MLS1	P30952	554 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	MCM7	P38132	845 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	HNT2	P49775	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	MTC3	P53077	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	MRPL22	P53881	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	TAH18	Q12181	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	BAP2	P38084	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	HXT13	P39924	564 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	PEA2	P40091	420 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	GNP1	P48813	663 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	HXT17	P53631	564 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	HXT15	P54854	567 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	MYO1	P08964	1928 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	RER2	P35196	286 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
DSS4	YPR017C	MNR2	P35724	969 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	PPM2	Q08282	695 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	PCL8	Q08966	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	COQ1	P18900	473 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	RTS1	P38903	757 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	YIL089W	P40500	205 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	RSM24	Q03976	319 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	CDA2	Q06703	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	YER152C	P10356	443 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	RAD53	P22216	821 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	PEP3	P27801	918 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	RFC5	P38251	354 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
DSS4	YPR017C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	RAD61	Q99359	647 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	CDC34	P14682	295 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	SNF5	P18480	905 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	CLN2	P20438	545 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	IMP2'	P32351	346 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	LYP1	P32487	611 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	CST26	P38226	397 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	VID27	P40157	782 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	SPO22	P40511	975 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	SPO20	Q04359	397 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	GNT1	Q12096	491 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DSS4	YPR017C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	SRM1	P21827	482 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	PRE8	P23639	250 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	YBL028C	P38202	106 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	PES4	P39684	611 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	VPS8	P39702	1274 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	MPH1	P40562	993 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	MAD1	P40957	749 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	TYW3	P53177	273 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	RIM8	P53179	542 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	SVF1	Q05515	481 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	SVS1	Q12254	260 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DSS4	YPR017C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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