RNA–Protein interactions for RNA: YOR197W

MCA1, Transcript of Ca2+-dependent cysteine protease, yeast

Gene MCA1, Length 1,299 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MCA1	YOR197W	TRM13	Q12383	476 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MCA1	YOR197W	FBP1	P09201	348 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	CEP3	P40969	608 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	HDA1	P53973	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	TOP3	P13099	656 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	EAF1	Q06337	982 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	GUP2	Q08929	609 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	RAD4	P14736	754 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	REC104	P33323	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	ERG5	P54781	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	RAD53	P22216	821 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	PET10	P36139	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	SDP1	P40479	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	YJL049W	P47048	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	ARE1	P25628	610 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	SUL1	P38359	859 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	CTF8	P38877	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	ERP6	P53198	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
MCA1	YOR197W	VPS30	Q02948	557 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	SPO75	Q07798	868 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	ENV7	Q12003	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	ERG4	P25340	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	CDC11	P32458	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	MOH1	P38191	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	TIM54	P47045	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	PEX19	Q07418	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	PPM2	Q08282	695 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	SSN2	P38931	1420 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCA1	YOR197W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	MRPS35	P53292	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	CIT1	P00890	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	CTF13	P35203	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	OAR1	P35731	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	KTR4	P38131	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	BRN1	P38170	754 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	YHR078W	P38799	552 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	GYP8	P43570	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	TAF8	Q03750	510 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	NSE3	Q05541	303 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
MCA1	YOR197W	YCL002C	P25565	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	BET3	P36149	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	OSW7	P43611	510 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	PUS2	P53167	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	DOS2	P54858	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	MUK1	Q02866	612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	GIS1	Q03833	894 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	DAL7	P21826	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	RTA1	P53047	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	HUL5	P53119	910 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	FLC1	Q08967	793 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	SWM1	Q12379	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	ALG7	P07286	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	VHR1	P40522	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	FKH2	P41813	862 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	STB4	P50104	949 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	TAD1	P53065	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	RNT1	Q02555	471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	TRM11	Q12463	433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MCA1	YOR197W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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