RNA–Protein interactions for RNA: YNL337W

YNL337W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL337W, Length 255 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL337W	YNL337W	RPD3	P32561	433 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	STB2	P46679	850 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	RIA1	P53893	1110 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	SPR28	Q04921	423 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	SPO11	P23179	398 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	DUT1	P33317	147 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	RGT2	Q12300	763 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	RPP1	P38786	293 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	IRC13	Q08630	104 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	SWM1	Q12379	170 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	GYP7	P48365	746 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	TYW3	P53177	273 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	CIR2	Q08822	631 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	DMC1	P25453	334 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	STE13	P33894	931 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	ESC2	Q06340	456 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	CTF8	P38877	133 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	IPL1	P38991	367 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	YJL206C	P39529	758 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	MPS1	P54199	764 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	TAF3	Q12297	353 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL337W	YNL337W	YEL020C	P39994	560 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	SEG1	Q04279	960 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	OSW1	Q08692	278 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	FYV10	P40492	516 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	DAM1	P53267	343 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	SGO1	Q08490	590 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	MEP2	P41948	499 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	YKE2	P52553	114 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	STE4	P18851	423 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	PTP1	P25044	335 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	NPP1	P25353	742 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	NET1	P47035	1189 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	SSL2	Q00578	843 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	ASM4	Q05166	528 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	VPS34	P22543	875 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	VHR1	P40522	640 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	AMA1	P50082	593 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	TEL2	P53038	688 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	MBP1	P39678	833 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	GEP3	Q08622	556 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YNL337W	YNL337W	SEC20	P28791	383 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	FMP52	P40008	231 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	AFR1	P33304	620 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	UBS1	P38290	277 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	BCD1	P38772	366 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	YHR078W	P38799	552 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	XBP1	P40489	647 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
YNL337W	YNL337W	CDC34	P14682	295 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
YNL337W	YNL337W	YIR042C	P40586	236 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	ASI2	P53895	289 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	SPO20	Q04359	397 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	YLR149C	Q99296	730 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	RPN13	O13563	156 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	ERG11	P10614	530 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	PAC2	P39937	518 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	LTP1	P40347	161 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	HOS4	P40480	1083 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	HDA1	P53973	706 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	YKR011C	Q02209	353 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	VPS30	Q02948	557 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	MPH2	P0CD99	609 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	HIR1	P32479	840 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	NDC80	P40460	691 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	ATE1	P16639	503 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	ERT1	P38140	529 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	not detected
YNL337W	YNL337W	CEP3	P40969	608 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	YJR107W	P47145	328 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	MET10	P39692	1035 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YNL337W	YNL337W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47 ms