RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	YKE2	P52553	114 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	HRQ1	Q05549	1077 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	FRE5	Q08908	694 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	ADY2	P25613	283 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	GIC1	P38785	314 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	PUS2	P53167	370 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	ERG5	P54781	538 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	VPS16	Q03308	798 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	UPC2	Q12151	913 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	MET3	P08536	511 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	FBP1	P09201	348 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	MRP8	P35719	219 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	PBY1	P38254	753 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	MRPS35	P53292	345 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	KIN3	P22209	435 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	SED4	P25365	1065 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	STE14	P32584	239 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	ORC2	P32833	620 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	IRR1	P40541	1150 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	GDE1	Q02979	1223 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	OPI10	Q08202	246 aa		2.58	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	VBA5	P36172	582 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	MAD1	P40957	749 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	TPO2	P53283	614 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	DLT1	Q04216	342 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	ADY4	Q05955	493 aa		2.57	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	ADE8	P04161	214 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	NPP2	P39997	493 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	ELO3	P40319	345 aa		2.56	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	AFR1	P33304	620 aa		2.55	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	STE13	P33894	931 aa		2.55	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	DMC1	P25453	334 aa		2.54	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	CTF8	P38877	133 aa		2.54	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	MBP1	P39678	833 aa		2.54	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	SDP1	P40479	209 aa		2.54	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	RIA1	P53893	1110 aa		2.54	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	SFB2	P53953	876 aa		2.54	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	LCD1	Q04377	747 aa		2.54	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	ESC2	Q06340	456 aa		2.54	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	PEX19	Q07418	342 aa		2.54	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	SPO11	P23179	398 aa		2.53	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	CDC11	P32458	415 aa		2.53	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	CTF13	P35203	478 aa		2.53	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	PCL5	P38794	229 aa		2.53	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	YJL049W	P47048	450 aa		2.53	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	CWC24	P53769	259 aa		2.53	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	VPS30	Q02948	557 aa		2.53	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	RIM13	Q03792	727 aa		2.53	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	SEG1	Q04279	960 aa		2.53	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	RGT2	Q12300	763 aa		2.53	□□□□□ -2
YJL135W	YJL135W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	NPP1	P25353	742 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	YKL069W	P36088	180 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	MPS1	P54199	764 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	TDA9	Q04545	1251 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	YDR306C	Q06640	478 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	TRM11	Q12463	433 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	PPH3	P32345	308 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	STE5	P32917	917 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	REC104	P33323	182 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	PFD1	P46988	109 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.51	□□□□□ -2.01	not detected
YJL135W	YJL135W	DAM1	P53267	343 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	HDA1	P53973	706 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	FMP25	Q08023	583 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	STE4	P18851	423 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	PET10	P36139	283 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	TOK1	P40310	691 aa		2.5	□□□□□ -2.01
YJL135W	YJL135W	LTP1	P40347	161 aa		2.5	□□□□□ -2.01

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