RNA–Protein interactions for RNA: YGL219C

MDM34, Transcript of Mitochondrial component of the ERMES complex, yeast

Gene MDM34, Length 1,380 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM34	YGL219C	GPT2	P36148	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YBL028C	P38202	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	HSM3	P38348	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	FAA3	P39002	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RSM25	P40496	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	GCV1	P48015	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YGR153W	P48238	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	ZDS2	P54786	942 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	DAL4	Q04895	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	GIC2	Q06648	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	CIR2	Q08822	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SEC39	Q12745	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SEN2	P16658	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	MEF1	P25039	761 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	OCA4	P25366	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PGS1	P25578	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PLC1	P32383	869 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	EXO5	P38289	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	IOC3	P43596	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	ALF1	P53904	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	MDM36	Q06820	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	MCD1	Q12158	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RED1	P14291	827 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	ATE1	P16639	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	EUG1	P32474	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SEC8	P32855	1065 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	VPS35	P34110	944 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PXA2	P34230	853 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	MIA40	P36046	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	NEM1	P38757	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PET100	P38958	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	UBP5	P39944	805 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	IES5	P40060	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	TMN3	P40071	706 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	VID27	P40157	782 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SLS1	P42900	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SHE10	P53075	577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RNT1	Q02555	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	MEC3	Q02574	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	ARO80	Q04052	950 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RRN11	Q04712	507 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YRM1	Q12340	786 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	CHS2	P14180	963 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	MNR2	P35724	969 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SEA4	P38164	1038 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YAP1801	P38856	637 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SPC72	P39723	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	VTC2	P43585	828 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YGR021W	P53212	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
MDM34	YGL219C	ULP1	Q02724	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	FUS2	Q05670	677 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	GNT1	Q12096	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	GAL1	P04385	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	DPB3	P27344	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	ITR1	P30605	584 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	PTH2	P34222	208 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	SPO74	P45819	413 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	SPO1	P53541	631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	SEC5	P89102	971 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	EAR1	Q03212	550 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	SPS1	P08458	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	YEL043W	P32618	956 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	MRPL40	P36534	297 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	CCL1	P37366	393 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	SLX1	P38324	304 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM34	YGL219C	MAD1	P40957	749 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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