RNA–Protein interactions for RNA: YKR085C

MRPL20, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL20, Length 588 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL20	YKR085C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	MFB1	Q04922	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	SPH1	Q06160	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	MMR1	Q06324	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	SUV3	P32580	737 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	TGL1	P34163	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	VPS8	P39702	1274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	VID27	P40157	782 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	YPP1	P46951	817 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	PIG1	Q06216	648 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	GUD1	Q07729	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	MBR1	P23493	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	SEG2	P34250	1132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	APN2	P38207	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	CSI1	Q04368	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	MOT1	P32333	1867 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	RGP1	P16664	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	GEF1	P37020	779 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	ATG3	P40344	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	OPT1	P40897	799 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	IOC3	P43596	787 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	IRC8	P47046	822 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	HDA1	P53973	706 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	NHA1	Q99271	985 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL20	YKR085C	SWI5	P08153	709 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	DAL5	P15365	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	DRE2	P36152	348 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	APM2	P38700	605 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	VPS45	P38932	577 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	YNL165W	P53891	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	SGO1	Q08490	590 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	NCB2	Q92317	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	HCM1	P25364	564 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	DID4	P36108	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	SVF1	Q05515	481 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
MRPL20	YKR085C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	YBL036C	P38197	257 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	ALG14	P38242	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	ARP1	P38696	384 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	RTS1	P38903	757 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	CCC2	P38995	1004 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	MOB1	P40484	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	HUL5	P53119	910 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	YML020W	Q03722	664 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	RAD61	Q99359	647 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	AI3	P03877	415 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	YKL097C	P34245	136 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	LEO1	P38439	464 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	PEX28	P38848	579 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	BUD16	P39988	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	PRK1	P40494	810 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	VPS30	Q02948	557 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	SUE1	Q06524	206 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	PEX19	Q07418	342 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	RRD2	Q12461	358 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	IRA2	P19158	3079 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	MCM1	P11746	286 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	ADK2	P26364	225 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	MSS51	P32335	436 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	COY1	P34237	679 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	PBY1	P38254	753 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	STB5	P38699	743 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	LIF1	P53150	421 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	LSB1	P53281	241 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	FOL1	P53848	824 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	TFB3	Q03290	321 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	GPI13	Q07830	1017 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	PEX1	P24004	1043 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	SLX1	P38324	304 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	YHL050C	P38721	697 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	YIR016W	P40572	265 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	CIT3	P43635	486 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL20	YKR085C	AVT1	P47082	602 aa		4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.1 ms