RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	DUS4	Q06063	367 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	RXT3	Q07458	294 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	GPB1	Q08886	897 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	NPP1	P25353	742 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	AFR1	P33304	620 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	HUL5	P53119	910 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	YGR012W	P53206	393 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	SFB2	P53953	876 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	LCD1	Q04377	747 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	NSE3	Q05541	303 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	BDF2	Q07442	638 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	CIT1	P00890	479 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	CDC6	P09119	513 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
CSE4	YKL049C	RPC82	P32349	654 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	DOM34	P33309	386 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	ERT1	P38140	529 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	YBR284W	P38150	797 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	POA1	P38218	177 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	IOC3	P43596	787 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	GCV2	P49095	1034 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	CDA1	Q06702	301 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	TPO1	Q07824	586 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	FLC1	Q08967	793 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSE4	YKL049C	HSF1	P10961	833 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	EMC1	P25574	760 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	OCA5	P38738	679 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	VPS62	P53285	467 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
CSE4	YKL049C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	HMI1	Q12039	706 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	YLR358C	O13565	187 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	SPE1	P08432	466 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
CSE4	YKL049C	CDC20	P26309	610 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	TOK1	P40310	691 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	HUL4	P40985	892 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	TAF8	Q03750	510 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	YAP6	Q03935	383 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	GAL11	P19659	1081 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	REC104	P33323	182 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	PET10	P36139	283 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	FLR1	P38124	548 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	MET12	P46151	657 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	YKE2	P52553	114 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	ADY3	Q07732	790 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	TOP3	P13099	656 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	ATG19	P35193	415 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	ESC8	Q08119	714 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	CAN1	P04817	590 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	HIS5	P07172	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	STE13	P33894	931 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	YKL222C	P35995	705 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	BET3	P36149	193 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	TAF1	P46677	1066 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	RTA1	P53047	317 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	TMA10	Q06177	86 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSE4	YKL049C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	STE11	P23561	717 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	YCR015C	P25616	317 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	LST4	P34239	828 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
CSE4	YKL049C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
CSE4	YKL049C	PLB1	P39105	664 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	GIP4	P39732	760 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	VPS30	Q02948	557 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	RPN4	Q03465	531 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	PPM2	Q08282	695 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	ENV7	Q12003	364 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSE4	YKL049C	CTS1	P29029	562 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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