RNA–Protein interactions for RNA: YJR087W

YJR087W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJR087W, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR087W	YJR087W	SPO75	Q07798	868 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	HMI1	Q12039	706 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	STE11	P23561	717 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	YBR184W	P38299	523 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	CCC2	P38995	1004 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	YAP6	Q03935	383 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	ADY3	Q07732	790 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	HIS5	P07172	385 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	SRP101	P32916	621 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	ATG19	P35193	415 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	SIT1	P39980	628 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	YER158C	P40095	573 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	CDA1	Q06702	301 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJR087W	YJR087W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	CTS1	P29029	562 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	CDC11	P32458	415 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	STE5	P32917	917 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	LST4	P34239	828 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	SFB2	P53953	876 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	TMA10	Q06177	86 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	SPE1	P08432	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	YRO2	P38079	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	NPP2	P39997	493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	CHA4	P43634	648 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	YJL049W	P47048	450 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	FMP25	Q08023	583 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	PLB1	P39105	664 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	ALR2	P43553	858 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	IOC3	P43596	787 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	PFD1	P46988	109 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	ERP6	P53198	216 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	EAF1	Q06337	982 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	YKE2	P52553	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	VPS30	Q02948	557 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	LCD1	Q04377	747 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	NPP1	P25353	742 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	HCM1	P25364	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	RAD4	P14736	754 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	ARE1	P25628	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	REC104	P33323	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	TRM2	P33753	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	DCG1	P32460	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	AFR1	P33304	620 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	TIM54	P47045	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	UBX5	Q06682	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJR087W	YJR087W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	STE13	P33894	931 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	YBR284W	P38150	797 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	TOK1	P40310	691 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	NNF1	P47149	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	NTO1	Q12311	748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	SED4	P25365	1065 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	PET10	P36139	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	HUL4	P40985	892 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	EXG2	P52911	562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	NCS6	P53088	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	GUP2	Q08929	609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	NPC2	Q12408	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	CIT1	P00890	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	ENB1	Q08299	606 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	UPC2	Q12151	913 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	PHO23	P50947	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
YJR087W	YJR087W	FLC1	Q08967	793 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	CEP3	P40969	608 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJR087W	YJR087W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.5 ms