RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA TPO1Q07824 586 aa4.3□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA RAD4P14736 754 aa4.29□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA PLB1P39105 664 aa4.29□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data4.29□□□□□ -1.72not detected
15S_rRNA15S_rRNA TPO2P53283 614 aa4.29□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA CTF4Q01454 927 aa4.29□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA SRP1Q02821 542 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA HRQ1Q05549 1077 aa4.29□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA FMP25Q08023 583 aa4.29□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA PFD1P46988 109 aa4.28□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA ADY3Q07732 790 aa4.28□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA OSH2Q12451 1283 aa4.28□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA YOL098CQ12496 1037 aa4.28□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA PMA1P05030 918 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data4.28□□□□□ -1.72not detected
15S_rRNA15S_rRNA ZRG8P40021 1076 aa4.28□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA ERP6P53198 216 aa4.28□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA UTP8P53276 713 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA DUS3Q06053 668 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA NOP12Q08208 459 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
15S_rRNA15S_rRNA ENA1P13587 1091 aa4.27□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA RPL8BP29453 256 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA PMI40P29952 429 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA CDC12P32468 407 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YAP1801P38856 637 aa4.27□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA AIM21P40563 679 aa4.27□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA TIM54P47045 478 aa4.27□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA ENA2Q01896 1091 aa4.27□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA NSE3Q05541 303 aa4.27□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA ENA5Q12691 1091 aa4.27□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA DCG1P32460 244 aa4.26□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA SAH1P39954 449 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA SIT1P39980 628 aa4.26□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA MET12P46151 657 aa4.26□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA EAF1Q06337 982 aa4.26□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YDR306CQ06640 478 aa4.26□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA BDF2Q07442 638 aa4.26□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA MDM38Q08179 573 aa4.26□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA HIS5P07172 385 aa4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA HSP60P19882 572 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA FUN30P31380 1131 aa4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA PPH3P32345 308 aa4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA AAR2P32357 355 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA CDC11P32458 415 aa4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA POA1P38218 177 aa4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA NPP2P39997 493 aa4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA ALR2P43553 858 aa4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA IOC3P43596 787 aa4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA CDA1Q06702 301 aa4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA CDC53Q12018 815 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA OSW2Q12202 724 aa4.25□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA ADE8P04161 214 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA ARE1P25628 610 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YKR078WP36158 585 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA GIC1P38785 314 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA CHA4P43634 648 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA HUL5P53119 910 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YGR125WP53273 1036 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA KIN4Q01919 800 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA SRT1Q03175 343 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YTA7P40340 1379 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA CIT1P00890 479 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA RAD53P22216 821 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA RPC82P32349 654 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA SRP40P32583 406 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA HBS1P32769 611 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA DEF1P35732 738 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YHR020WP38708 688 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA CHS7P38843 316 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA MSS4P38994 779 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA GYP7P48365 746 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA FLC1Q08967 793 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YOR131CQ12486 218 aa4.24□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA SRP101P32916 621 aa4.23□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA GGA2P38817 585 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA CCC2P38995 1004 aa4.23□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA HUL4P40985 892 aa4.23□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YGR012WP53206 393 aa4.23□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA KCS1Q12494 1050 aa4.23□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA ECM21P38167 1117 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA EXG2P52911 562 aa4.22□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA RPN4Q03465 531 aa4.22□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA UBX5Q06682 500 aa4.22□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA SPE1P08432 466 aa4.21□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA GAL11P19659 1081 aa4.21□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YKL091CP33324 310 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YRO2P38079 344 aa4.21□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YER158CP40095 573 aa4.21□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA TAF8Q03750 510 aa4.21□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA LCD1Q04377 747 aa4.21□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA LAS17Q12446 633 aa4.21□□□□□ -1.73
15S_rRNA15S_rRNA YBR238CP38330 731 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA TSL1P38427 1098 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA RSP5P39940 809 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA CCM1P48237 864 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA SFB2P53953 876 aa4.21□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.21□□□□□ -1.74not detected
15S_rRNA15S_rRNA URN1Q06525 465 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.8 ms