RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	ATG3	P40344	310 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	RGD2	P43556	714 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	PCL10	P53124	433 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	UME1	Q03010	460 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	SML1	Q04964	104 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	ADR1	P07248	1323 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	TFC3	P34111	1160 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	LDH1	P38139	375 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	LIF1	P53150	421 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	DSE4	P53753	1117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	APC5	Q08683	685 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	PCL8	Q08966	492 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	SEC39	Q12745	709 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	VPS5	Q92331	675 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	SMI1	P32566	505 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	RPC25	P35718	212 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	YTA12	P40341	825 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	ADY3	Q07732	790 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	OPI1	P21957	404 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	RTS3	P53289	263 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	MLH2	Q07980	695 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	ELM1	P32801	640 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	SLX8	P40072	274 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	YPL191C	Q08930	360 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	GYP5	Q12344	894 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	GCN2	P15442	1659 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	RIT1	P23796	513 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	TBS1	P38114	1094 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	ACF4	P47129	309 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	MRPS35	P53292	345 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	SPO20	Q04359	397 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	CDC16	P09798	840 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	PDR1	P12383	1068 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	VPS34	P22543	875 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	RER2	P35196	286 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	ORC6	P38826	435 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	YTA6	P40328	754 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	SHE4	P51534	789 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	YMR102C	Q03177	834 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	APL4	Q12028	832 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	REV7	P38927	245 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	SHU2	P38957	223 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	ECM1	P39715	212 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	TOS3	P43637	560 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	UBP15	P50101	1230 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	GTB1	Q04924	702 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	BCP1	Q06338	283 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	IOC2	Q12072	812 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RRP5	YMR229C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	RRN3	P36070	627 aa		3.53	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	DOT5	P40553	215 aa		3.53	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	UBA2	P52488	636 aa		3.53	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	SEC5	P89102	971 aa		3.53	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	ARP7	Q12406	477 aa		3.53	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.52	□□□□□ -1.85	not detected
RRP5	YMR229C	YET1	P35723	206 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	PPS1	P38148	807 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	PPX1	P38698	397 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	ACA1	P39970	489 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	YIR042C	P40586	236 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	EFM6	P53970	246 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	MSH6	Q03834	1242 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	SPO71	Q03868	1245 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	TRS120	Q04183	1289 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	THI3	Q07471	609 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	MRPS28	P21771	286 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	AAD3	P25612	363 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	IRE1	P32361	1115 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	YME2	P32843	850 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	PTH2	P34222	208 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	DSF2	P38213	736 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RRP5	YMR229C	FES1	P38260	290 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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