RNA–Protein interactions for RNA: YGL174W

BUD13, Transcript of Subunit of the RES complex, yeast

Gene BUD13, Length 801 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD13	YGL174W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
BUD13	YGL174W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	FYV10	P40492	516 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	IRC8	P47046	822 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	YJL007C	P47080	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	AVT1	P47082	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	ALD3	P54114	506 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	EST2	Q06163	884 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	THI3	Q07471	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	PPM2	Q08282	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	GSY2	P27472	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	SCD5	P34758	872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	RER2	P35196	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	APM2	P38700	605 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	AKR1	P39010	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	YIR042C	P40586	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	YNR040W	P53736	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	INM2	Q05533	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	MED7	Q08278	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	PMD1	P32634	1753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	COQ1	P18900	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	MGM1	P32266	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	COQ2	P32378	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	YKR073C	P36153	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	GRX7	P38068	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	WAR1	Q03631	944 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	CTI6	Q08923	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	FIG2	P25653	1609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	TRP3	P00937	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	CBP3	P21560	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	UBP1	P25037	809 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	PEP12	P32854	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	KAE1	P36132	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	IOC3	P43596	787 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	CTH1	P47976	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	UFD2	P54860	961 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	BUG1	Q12191	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	SFI1	Q12369	946 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	HKR1	P41809	1802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	CYB2	P00175	591 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	HXT5	P38695	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	TCD1	P38756	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	NPR2	P39923	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	OSW7	P43611	510 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
BUD13	YGL174W	HDA1	P53973	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	TFC6	Q06339	672 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	DCS2	Q12123	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	SLP1	Q12232	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	MRP10	O75012	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	CDC6	P09119	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	CDC15	P27636	974 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	ANP1	P32629	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	GEF1	P37020	779 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	PSY4	P38193	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	CEP3	P40969	608 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	BDF2	Q07442	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	IDI1	P15496	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	RSC6	P25632	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	SPC110	P32380	944 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	MDL2	P33311	773 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	LTV1	P34078	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	VPS75	P53853	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	FAR11	P53917	953 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	VPS60	Q03390	229 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD13	YGL174W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.2 ms