Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
AP4B1Q9Y6B7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
AP4B1Q9Y6B7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
AP4B1Q9Y6B7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
AP4B1Q9Y6B7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
AP4B1Q9Y6B7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
AP4B1Q9Y6B7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
AP4B1Q9Y6B7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
AP4B1Q9Y6B7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
AP4B1Q9Y6B7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
AP4B1Q9Y6B7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
AP4B1Q9Y6B7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
AP4B1Q9Y6B7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
AP4B1Q9Y6B7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
AP4B1Q9Y6B7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
AP4B1Q9Y6B7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AP4B1Q9Y6B7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
AP4B1Q9Y6B7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
AP4B1Q9Y6B7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AP4B1Q9Y6B7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AP4B1Q9Y6B7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AP4B1Q9Y6B7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
AP4B1Q9Y6B7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AP4B1Q9Y6B7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AP4B1Q9Y6B7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP4B1Q9Y6B7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AP4B1Q9Y6B7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AP4B1Q9Y6B7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP4B1Q9Y6B7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AP4B1Q9Y6B7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AP4B1Q9Y6B7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AP4B1Q9Y6B7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
AP4B1Q9Y6B7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AP4B1Q9Y6B7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AP4B1Q9Y6B7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AP4B1Q9Y6B7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AP4B1Q9Y6B7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AP4B1Q9Y6B7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP4B1Q9Y6B7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AP4B1Q9Y6B7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP4B1Q9Y6B7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP4B1Q9Y6B7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AP4B1Q9Y6B7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP4B1Q9Y6B7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP4B1Q9Y6B7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP4B1Q9Y6B7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP4B1Q9Y6B7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP4B1Q9Y6B7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AP4B1Q9Y6B7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AP4B1Q9Y6B7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP4B1Q9Y6B7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AP4B1Q9Y6B7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP4B1Q9Y6B7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP4B1Q9Y6B7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP4B1Q9Y6B7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP4B1Q9Y6B7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP4B1Q9Y6B7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP4B1Q9Y6B7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP4B1Q9Y6B7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP4B1Q9Y6B7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP4B1Q9Y6B7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP4B1Q9Y6B7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AP4B1Q9Y6B7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP4B1Q9Y6B7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AP4B1Q9Y6B7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AP4B1Q9Y6B7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AP4B1Q9Y6B7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AP4B1Q9Y6B7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AP4B1Q9Y6B7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AP4B1Q9Y6B7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AP4B1Q9Y6B7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP4B1Q9Y6B7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP4B1Q9Y6B7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP4B1Q9Y6B7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AP4B1Q9Y6B7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AP4B1Q9Y6B7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP4B1Q9Y6B7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP4B1Q9Y6B7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP4B1Q9Y6B7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP4B1Q9Y6B7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AP4B1Q9Y6B7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP4B1Q9Y6B7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP4B1Q9Y6B7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP4B1Q9Y6B7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP4B1Q9Y6B7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP4B1Q9Y6B7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP4B1Q9Y6B7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP4B1Q9Y6B7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP4B1Q9Y6B7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP4B1Q9Y6B7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AP4B1Q9Y6B7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AP4B1Q9Y6B7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AP4B1Q9Y6B7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP4B1Q9Y6B7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP4B1Q9Y6B7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP4B1Q9Y6B7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP4B1Q9Y6B7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP4B1Q9Y6B7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP4B1Q9Y6B7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
AP4B1Q9Y6B7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms