Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y623

MYH4, Myosin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH4Q9Y623 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
MYH4Q9Y623 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
MYH4Q9Y623 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
MYH4Q9Y623 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
MYH4Q9Y623 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
MYH4Q9Y623 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
MYH4Q9Y623 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
MYH4Q9Y623 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
MYH4Q9Y623 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MYH4Q9Y623 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
MYH4Q9Y623 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
MYH4Q9Y623 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MYH4Q9Y623 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
MYH4Q9Y623 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
MYH4Q9Y623 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
MYH4Q9Y623 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
MYH4Q9Y623 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
MYH4Q9Y623 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
MYH4Q9Y623 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
MYH4Q9Y623 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
MYH4Q9Y623 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
MYH4Q9Y623 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
MYH4Q9Y623 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
MYH4Q9Y623 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
MYH4Q9Y623 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
MYH4Q9Y623 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
MYH4Q9Y623 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MYH4Q9Y623 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
MYH4Q9Y623 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MYH4Q9Y623 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
MYH4Q9Y623 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
MYH4Q9Y623 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MYH4Q9Y623 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MYH4Q9Y623 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MYH4Q9Y623 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MYH4Q9Y623 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MYH4Q9Y623 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
MYH4Q9Y623 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
MYH4Q9Y623 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
MYH4Q9Y623 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MYH4Q9Y623 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
MYH4Q9Y623 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
MYH4Q9Y623 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MYH4Q9Y623 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
MYH4Q9Y623 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
MYH4Q9Y623 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MYH4Q9Y623 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
MYH4Q9Y623 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MYH4Q9Y623 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MYH4Q9Y623 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
MYH4Q9Y623 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
MYH4Q9Y623 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
MYH4Q9Y623 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
MYH4Q9Y623 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MYH4Q9Y623 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MYH4Q9Y623 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
MYH4Q9Y623 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
MYH4Q9Y623 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MYH4Q9Y623 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MYH4Q9Y623 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MYH4Q9Y623 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MYH4Q9Y623 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MYH4Q9Y623 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYH4Q9Y623 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
MYH4Q9Y623 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
MYH4Q9Y623 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MYH4Q9Y623 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MYH4Q9Y623 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MYH4Q9Y623 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MYH4Q9Y623 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MYH4Q9Y623 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MYH4Q9Y623 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
MYH4Q9Y623 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MYH4Q9Y623 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MYH4Q9Y623 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MYH4Q9Y623 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYH4Q9Y623 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYH4Q9Y623 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYH4Q9Y623 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYH4Q9Y623 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MYH4Q9Y623 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYH4Q9Y623 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MYH4Q9Y623 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MYH4Q9Y623 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MYH4Q9Y623 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MYH4Q9Y623 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MYH4Q9Y623 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MYH4Q9Y623 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MYH4Q9Y623 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
MYH4Q9Y623 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MYH4Q9Y623 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MYH4Q9Y623 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MYH4Q9Y623 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYH4Q9Y623 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYH4Q9Y623 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MYH4Q9Y623 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MYH4Q9Y623 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYH4Q9Y623 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MYH4Q9Y623 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MYH4Q9Y623 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms