Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
HPCAL4Q9UM19 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
HPCAL4Q9UM19 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
HPCAL4Q9UM19 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HPCAL4Q9UM19 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HPCAL4Q9UM19 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HPCAL4Q9UM19 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HPCAL4Q9UM19 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
HPCAL4Q9UM19 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HPCAL4Q9UM19 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HPCAL4Q9UM19 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HPCAL4Q9UM19 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HPCAL4Q9UM19 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HPCAL4Q9UM19 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HPCAL4Q9UM19 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HPCAL4Q9UM19 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HPCAL4Q9UM19 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HPCAL4Q9UM19 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
HPCAL4Q9UM19 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HPCAL4Q9UM19 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HPCAL4Q9UM19 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HPCAL4Q9UM19 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HPCAL4Q9UM19 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HPCAL4Q9UM19 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HPCAL4Q9UM19 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HPCAL4Q9UM19 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HPCAL4Q9UM19 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HPCAL4Q9UM19 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HPCAL4Q9UM19 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HPCAL4Q9UM19 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HPCAL4Q9UM19 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HPCAL4Q9UM19 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HPCAL4Q9UM19 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HPCAL4Q9UM19 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HPCAL4Q9UM19 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HPCAL4Q9UM19 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HPCAL4Q9UM19 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HPCAL4Q9UM19 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HPCAL4Q9UM19 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HPCAL4Q9UM19 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HPCAL4Q9UM19 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HPCAL4Q9UM19 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HPCAL4Q9UM19 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HPCAL4Q9UM19 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HPCAL4Q9UM19 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
HPCAL4Q9UM19 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HPCAL4Q9UM19 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HPCAL4Q9UM19 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HPCAL4Q9UM19 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HPCAL4Q9UM19 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HPCAL4Q9UM19 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HPCAL4Q9UM19 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HPCAL4Q9UM19 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HPCAL4Q9UM19 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HPCAL4Q9UM19 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HPCAL4Q9UM19 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HPCAL4Q9UM19 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HPCAL4Q9UM19 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HPCAL4Q9UM19 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HPCAL4Q9UM19 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HPCAL4Q9UM19 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HPCAL4Q9UM19 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HPCAL4Q9UM19 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HPCAL4Q9UM19 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HPCAL4Q9UM19 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HPCAL4Q9UM19 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HPCAL4Q9UM19 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HPCAL4Q9UM19 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HPCAL4Q9UM19 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HPCAL4Q9UM19 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HPCAL4Q9UM19 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HPCAL4Q9UM19 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HPCAL4Q9UM19 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
HPCAL4Q9UM19 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HPCAL4Q9UM19 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HPCAL4Q9UM19 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HPCAL4Q9UM19 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HPCAL4Q9UM19 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HPCAL4Q9UM19 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HPCAL4Q9UM19 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HPCAL4Q9UM19 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HPCAL4Q9UM19 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HPCAL4Q9UM19 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HPCAL4Q9UM19 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HPCAL4Q9UM19 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
HPCAL4Q9UM19 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HPCAL4Q9UM19 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HPCAL4Q9UM19 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HPCAL4Q9UM19 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HPCAL4Q9UM19 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HPCAL4Q9UM19 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HPCAL4Q9UM19 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HPCAL4Q9UM19 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HPCAL4Q9UM19 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HPCAL4Q9UM19 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HPCAL4Q9UM19 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HPCAL4Q9UM19 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HPCAL4Q9UM19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HPCAL4Q9UM19 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HPCAL4Q9UM19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms