Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVT9

ARMC1, Armadillo repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC1Q9NVT9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ARMC1Q9NVT9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ARMC1Q9NVT9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARMC1Q9NVT9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARMC1Q9NVT9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARMC1Q9NVT9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARMC1Q9NVT9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARMC1Q9NVT9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARMC1Q9NVT9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARMC1Q9NVT9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ARMC1Q9NVT9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARMC1Q9NVT9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARMC1Q9NVT9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARMC1Q9NVT9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARMC1Q9NVT9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARMC1Q9NVT9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARMC1Q9NVT9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARMC1Q9NVT9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARMC1Q9NVT9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARMC1Q9NVT9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARMC1Q9NVT9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARMC1Q9NVT9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARMC1Q9NVT9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARMC1Q9NVT9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARMC1Q9NVT9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARMC1Q9NVT9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARMC1Q9NVT9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARMC1Q9NVT9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARMC1Q9NVT9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARMC1Q9NVT9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARMC1Q9NVT9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARMC1Q9NVT9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARMC1Q9NVT9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARMC1Q9NVT9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARMC1Q9NVT9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARMC1Q9NVT9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARMC1Q9NVT9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARMC1Q9NVT9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARMC1Q9NVT9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARMC1Q9NVT9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARMC1Q9NVT9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARMC1Q9NVT9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARMC1Q9NVT9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARMC1Q9NVT9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARMC1Q9NVT9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARMC1Q9NVT9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARMC1Q9NVT9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARMC1Q9NVT9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARMC1Q9NVT9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARMC1Q9NVT9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARMC1Q9NVT9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARMC1Q9NVT9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARMC1Q9NVT9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARMC1Q9NVT9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARMC1Q9NVT9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARMC1Q9NVT9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARMC1Q9NVT9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARMC1Q9NVT9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARMC1Q9NVT9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARMC1Q9NVT9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARMC1Q9NVT9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARMC1Q9NVT9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARMC1Q9NVT9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARMC1Q9NVT9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARMC1Q9NVT9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARMC1Q9NVT9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARMC1Q9NVT9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARMC1Q9NVT9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARMC1Q9NVT9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARMC1Q9NVT9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARMC1Q9NVT9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARMC1Q9NVT9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARMC1Q9NVT9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARMC1Q9NVT9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARMC1Q9NVT9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARMC1Q9NVT9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARMC1Q9NVT9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARMC1Q9NVT9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARMC1Q9NVT9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARMC1Q9NVT9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARMC1Q9NVT9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARMC1Q9NVT9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARMC1Q9NVT9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARMC1Q9NVT9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARMC1Q9NVT9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARMC1Q9NVT9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARMC1Q9NVT9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARMC1Q9NVT9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARMC1Q9NVT9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARMC1Q9NVT9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARMC1Q9NVT9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARMC1Q9NVT9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARMC1Q9NVT9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARMC1Q9NVT9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARMC1Q9NVT9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARMC1Q9NVT9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARMC1Q9NVT9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARMC1Q9NVT9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARMC1Q9NVT9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARMC1Q9NVT9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms