Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ2

GSN-AS1, Putative uncharacterized protein GSN-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSN-AS1Q9NRJ2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GSN-AS1Q9NRJ2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GSN-AS1Q9NRJ2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSN-AS1Q9NRJ2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSN-AS1Q9NRJ2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSN-AS1Q9NRJ2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSN-AS1Q9NRJ2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSN-AS1Q9NRJ2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GSN-AS1Q9NRJ2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSN-AS1Q9NRJ2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSN-AS1Q9NRJ2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSN-AS1Q9NRJ2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSN-AS1Q9NRJ2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSN-AS1Q9NRJ2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSN-AS1Q9NRJ2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSN-AS1Q9NRJ2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSN-AS1Q9NRJ2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSN-AS1Q9NRJ2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSN-AS1Q9NRJ2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSN-AS1Q9NRJ2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSN-AS1Q9NRJ2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSN-AS1Q9NRJ2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSN-AS1Q9NRJ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSN-AS1Q9NRJ2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSN-AS1Q9NRJ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GSN-AS1Q9NRJ2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSN-AS1Q9NRJ2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSN-AS1Q9NRJ2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSN-AS1Q9NRJ2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GSN-AS1Q9NRJ2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSN-AS1Q9NRJ2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSN-AS1Q9NRJ2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSN-AS1Q9NRJ2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSN-AS1Q9NRJ2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSN-AS1Q9NRJ2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSN-AS1Q9NRJ2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSN-AS1Q9NRJ2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSN-AS1Q9NRJ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GSN-AS1Q9NRJ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSN-AS1Q9NRJ2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSN-AS1Q9NRJ2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSN-AS1Q9NRJ2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSN-AS1Q9NRJ2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSN-AS1Q9NRJ2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSN-AS1Q9NRJ2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSN-AS1Q9NRJ2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSN-AS1Q9NRJ2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSN-AS1Q9NRJ2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSN-AS1Q9NRJ2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSN-AS1Q9NRJ2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSN-AS1Q9NRJ2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSN-AS1Q9NRJ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSN-AS1Q9NRJ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSN-AS1Q9NRJ2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSN-AS1Q9NRJ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GSN-AS1Q9NRJ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSN-AS1Q9NRJ2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSN-AS1Q9NRJ2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSN-AS1Q9NRJ2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSN-AS1Q9NRJ2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSN-AS1Q9NRJ2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSN-AS1Q9NRJ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSN-AS1Q9NRJ2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSN-AS1Q9NRJ2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSN-AS1Q9NRJ2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSN-AS1Q9NRJ2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSN-AS1Q9NRJ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSN-AS1Q9NRJ2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSN-AS1Q9NRJ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSN-AS1Q9NRJ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSN-AS1Q9NRJ2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSN-AS1Q9NRJ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSN-AS1Q9NRJ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSN-AS1Q9NRJ2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSN-AS1Q9NRJ2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSN-AS1Q9NRJ2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSN-AS1Q9NRJ2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSN-AS1Q9NRJ2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSN-AS1Q9NRJ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSN-AS1Q9NRJ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSN-AS1Q9NRJ2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSN-AS1Q9NRJ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSN-AS1Q9NRJ2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSN-AS1Q9NRJ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSN-AS1Q9NRJ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSN-AS1Q9NRJ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSN-AS1Q9NRJ2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSN-AS1Q9NRJ2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSN-AS1Q9NRJ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSN-AS1Q9NRJ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSN-AS1Q9NRJ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSN-AS1Q9NRJ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSN-AS1Q9NRJ2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSN-AS1Q9NRJ2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSN-AS1Q9NRJ2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSN-AS1Q9NRJ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSN-AS1Q9NRJ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSN-AS1Q9NRJ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSN-AS1Q9NRJ2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSN-AS1Q9NRJ2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms