Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH2

ISYNA1, Inositol-3-phosphate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISYNA1Q9NPH2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ISYNA1Q9NPH2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ISYNA1Q9NPH2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ISYNA1Q9NPH2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ISYNA1Q9NPH2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ISYNA1Q9NPH2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ISYNA1Q9NPH2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ISYNA1Q9NPH2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ISYNA1Q9NPH2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ISYNA1Q9NPH2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ISYNA1Q9NPH2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ISYNA1Q9NPH2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ISYNA1Q9NPH2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ISYNA1Q9NPH2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ISYNA1Q9NPH2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ISYNA1Q9NPH2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ISYNA1Q9NPH2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ISYNA1Q9NPH2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ISYNA1Q9NPH2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ISYNA1Q9NPH2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ISYNA1Q9NPH2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ISYNA1Q9NPH2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ISYNA1Q9NPH2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ISYNA1Q9NPH2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ISYNA1Q9NPH2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ISYNA1Q9NPH2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ISYNA1Q9NPH2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ISYNA1Q9NPH2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ISYNA1Q9NPH2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ISYNA1Q9NPH2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ISYNA1Q9NPH2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ISYNA1Q9NPH2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ISYNA1Q9NPH2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ISYNA1Q9NPH2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ISYNA1Q9NPH2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ISYNA1Q9NPH2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ISYNA1Q9NPH2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ISYNA1Q9NPH2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ISYNA1Q9NPH2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ISYNA1Q9NPH2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ISYNA1Q9NPH2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ISYNA1Q9NPH2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ISYNA1Q9NPH2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ISYNA1Q9NPH2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ISYNA1Q9NPH2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ISYNA1Q9NPH2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ISYNA1Q9NPH2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISYNA1Q9NPH2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ISYNA1Q9NPH2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ISYNA1Q9NPH2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ISYNA1Q9NPH2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ISYNA1Q9NPH2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ISYNA1Q9NPH2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ISYNA1Q9NPH2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ISYNA1Q9NPH2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ISYNA1Q9NPH2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ISYNA1Q9NPH2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ISYNA1Q9NPH2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ISYNA1Q9NPH2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ISYNA1Q9NPH2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ISYNA1Q9NPH2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ISYNA1Q9NPH2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ISYNA1Q9NPH2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ISYNA1Q9NPH2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ISYNA1Q9NPH2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ISYNA1Q9NPH2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ISYNA1Q9NPH2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ISYNA1Q9NPH2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ISYNA1Q9NPH2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ISYNA1Q9NPH2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ISYNA1Q9NPH2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ISYNA1Q9NPH2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ISYNA1Q9NPH2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ISYNA1Q9NPH2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ISYNA1Q9NPH2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ISYNA1Q9NPH2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ISYNA1Q9NPH2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ISYNA1Q9NPH2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ISYNA1Q9NPH2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ISYNA1Q9NPH2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ISYNA1Q9NPH2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ISYNA1Q9NPH2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ISYNA1Q9NPH2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ISYNA1Q9NPH2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ISYNA1Q9NPH2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ISYNA1Q9NPH2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ISYNA1Q9NPH2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ISYNA1Q9NPH2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ISYNA1Q9NPH2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ISYNA1Q9NPH2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ISYNA1Q9NPH2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ISYNA1Q9NPH2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ISYNA1Q9NPH2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ISYNA1Q9NPH2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ISYNA1Q9NPH2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ISYNA1Q9NPH2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ISYNA1Q9NPH2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ISYNA1Q9NPH2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ISYNA1Q9NPH2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ISYNA1Q9NPH2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms