Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A6AQ9H2W1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A6AQ9H2W1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A6AQ9H2W1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A6AQ9H2W1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A6AQ9H2W1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A6AQ9H2W1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MS4A6AQ9H2W1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A6AQ9H2W1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A6AQ9H2W1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A6AQ9H2W1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A6AQ9H2W1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A6AQ9H2W1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A6AQ9H2W1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A6AQ9H2W1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A6AQ9H2W1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A6AQ9H2W1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A6AQ9H2W1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A6AQ9H2W1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A6AQ9H2W1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A6AQ9H2W1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A6AQ9H2W1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A6AQ9H2W1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A6AQ9H2W1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A6AQ9H2W1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A6AQ9H2W1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A6AQ9H2W1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A6AQ9H2W1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A6AQ9H2W1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A6AQ9H2W1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A6AQ9H2W1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6AQ9H2W1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A6AQ9H2W1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A6AQ9H2W1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A6AQ9H2W1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A6AQ9H2W1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A6AQ9H2W1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A6AQ9H2W1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A6AQ9H2W1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A6AQ9H2W1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A6AQ9H2W1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A6AQ9H2W1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A6AQ9H2W1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A6AQ9H2W1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A6AQ9H2W1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A6AQ9H2W1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A6AQ9H2W1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A6AQ9H2W1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6AQ9H2W1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6AQ9H2W1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6AQ9H2W1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A6AQ9H2W1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A6AQ9H2W1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A6AQ9H2W1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A6AQ9H2W1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6AQ9H2W1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A6AQ9H2W1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A6AQ9H2W1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A6AQ9H2W1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A6AQ9H2W1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A6AQ9H2W1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6AQ9H2W1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A6AQ9H2W1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6AQ9H2W1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A6AQ9H2W1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6AQ9H2W1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A6AQ9H2W1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A6AQ9H2W1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A6AQ9H2W1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A6AQ9H2W1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A6AQ9H2W1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A6AQ9H2W1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A6AQ9H2W1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A6AQ9H2W1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A6AQ9H2W1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A6AQ9H2W1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A6AQ9H2W1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A6AQ9H2W1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A6AQ9H2W1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A6AQ9H2W1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A6AQ9H2W1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A6AQ9H2W1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A6AQ9H2W1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A6AQ9H2W1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A6AQ9H2W1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A6AQ9H2W1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A6AQ9H2W1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A6AQ9H2W1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A6AQ9H2W1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A6AQ9H2W1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A6AQ9H2W1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A6AQ9H2W1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A6AQ9H2W1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A6AQ9H2W1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A6AQ9H2W1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6AQ9H2W1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6AQ9H2W1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A6AQ9H2W1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A6AQ9H2W1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A6AQ9H2W1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms