Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GANQ9H2C0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GANQ9H2C0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
GANQ9H2C0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GANQ9H2C0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GANQ9H2C0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GANQ9H2C0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GANQ9H2C0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GANQ9H2C0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GANQ9H2C0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GANQ9H2C0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
GANQ9H2C0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GANQ9H2C0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GANQ9H2C0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GANQ9H2C0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GANQ9H2C0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GANQ9H2C0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GANQ9H2C0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GANQ9H2C0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GANQ9H2C0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GANQ9H2C0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GANQ9H2C0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GANQ9H2C0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GANQ9H2C0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GANQ9H2C0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
GANQ9H2C0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GANQ9H2C0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GANQ9H2C0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GANQ9H2C0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GANQ9H2C0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
GANQ9H2C0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GANQ9H2C0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GANQ9H2C0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GANQ9H2C0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GANQ9H2C0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GANQ9H2C0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GANQ9H2C0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GANQ9H2C0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GANQ9H2C0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GANQ9H2C0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GANQ9H2C0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GANQ9H2C0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GANQ9H2C0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GANQ9H2C0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GANQ9H2C0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GANQ9H2C0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GANQ9H2C0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GANQ9H2C0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GANQ9H2C0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GANQ9H2C0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GANQ9H2C0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GANQ9H2C0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GANQ9H2C0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GANQ9H2C0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GANQ9H2C0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GANQ9H2C0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GANQ9H2C0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GANQ9H2C0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GANQ9H2C0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GANQ9H2C0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GANQ9H2C0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GANQ9H2C0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GANQ9H2C0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GANQ9H2C0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GANQ9H2C0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GANQ9H2C0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GANQ9H2C0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GANQ9H2C0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GANQ9H2C0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GANQ9H2C0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GANQ9H2C0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
GANQ9H2C0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GANQ9H2C0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GANQ9H2C0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
GANQ9H2C0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GANQ9H2C0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GANQ9H2C0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GANQ9H2C0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GANQ9H2C0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GANQ9H2C0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GANQ9H2C0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
GANQ9H2C0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GANQ9H2C0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GANQ9H2C0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GANQ9H2C0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GANQ9H2C0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GANQ9H2C0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GANQ9H2C0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GANQ9H2C0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GANQ9H2C0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GANQ9H2C0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GANQ9H2C0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GANQ9H2C0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GANQ9H2C0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GANQ9H2C0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GANQ9H2C0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GANQ9H2C0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GANQ9H2C0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GANQ9H2C0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GANQ9H2C0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms