Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2B2

SYT4, Synaptotagmin-4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT4Q9H2B2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYT4Q9H2B2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYT4Q9H2B2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
SYT4Q9H2B2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYT4Q9H2B2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYT4Q9H2B2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYT4Q9H2B2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYT4Q9H2B2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYT4Q9H2B2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT4Q9H2B2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYT4Q9H2B2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYT4Q9H2B2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT4Q9H2B2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT4Q9H2B2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT4Q9H2B2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT4Q9H2B2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT4Q9H2B2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT4Q9H2B2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT4Q9H2B2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYT4Q9H2B2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT4Q9H2B2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYT4Q9H2B2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYT4Q9H2B2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYT4Q9H2B2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYT4Q9H2B2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYT4Q9H2B2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYT4Q9H2B2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYT4Q9H2B2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT4Q9H2B2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT4Q9H2B2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT4Q9H2B2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYT4Q9H2B2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYT4Q9H2B2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT4Q9H2B2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT4Q9H2B2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT4Q9H2B2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT4Q9H2B2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT4Q9H2B2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYT4Q9H2B2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYT4Q9H2B2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYT4Q9H2B2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYT4Q9H2B2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYT4Q9H2B2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYT4Q9H2B2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYT4Q9H2B2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYT4Q9H2B2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYT4Q9H2B2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYT4Q9H2B2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT4Q9H2B2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT4Q9H2B2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT4Q9H2B2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT4Q9H2B2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT4Q9H2B2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYT4Q9H2B2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYT4Q9H2B2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYT4Q9H2B2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYT4Q9H2B2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT4Q9H2B2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT4Q9H2B2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT4Q9H2B2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT4Q9H2B2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT4Q9H2B2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT4Q9H2B2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT4Q9H2B2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT4Q9H2B2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT4Q9H2B2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT4Q9H2B2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT4Q9H2B2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT4Q9H2B2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT4Q9H2B2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT4Q9H2B2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT4Q9H2B2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT4Q9H2B2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT4Q9H2B2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT4Q9H2B2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT4Q9H2B2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT4Q9H2B2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT4Q9H2B2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT4Q9H2B2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT4Q9H2B2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT4Q9H2B2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT4Q9H2B2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT4Q9H2B2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT4Q9H2B2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT4Q9H2B2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT4Q9H2B2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT4Q9H2B2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT4Q9H2B2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT4Q9H2B2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT4Q9H2B2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT4Q9H2B2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT4Q9H2B2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT4Q9H2B2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT4Q9H2B2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT4Q9H2B2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT4Q9H2B2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT4Q9H2B2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT4Q9H2B2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT4Q9H2B2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT4Q9H2B2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms