Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E4

GRIP2, Glutamate receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP2Q9C0E4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIP2Q9C0E4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIP2Q9C0E4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIP2Q9C0E4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIP2Q9C0E4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIP2Q9C0E4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIP2Q9C0E4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIP2Q9C0E4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIP2Q9C0E4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIP2Q9C0E4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIP2Q9C0E4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIP2Q9C0E4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIP2Q9C0E4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIP2Q9C0E4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIP2Q9C0E4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIP2Q9C0E4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIP2Q9C0E4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIP2Q9C0E4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIP2Q9C0E4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIP2Q9C0E4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIP2Q9C0E4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIP2Q9C0E4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIP2Q9C0E4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIP2Q9C0E4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIP2Q9C0E4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIP2Q9C0E4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIP2Q9C0E4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIP2Q9C0E4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIP2Q9C0E4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIP2Q9C0E4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIP2Q9C0E4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIP2Q9C0E4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIP2Q9C0E4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIP2Q9C0E4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIP2Q9C0E4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIP2Q9C0E4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIP2Q9C0E4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIP2Q9C0E4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIP2Q9C0E4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIP2Q9C0E4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIP2Q9C0E4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIP2Q9C0E4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIP2Q9C0E4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIP2Q9C0E4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIP2Q9C0E4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIP2Q9C0E4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIP2Q9C0E4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIP2Q9C0E4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIP2Q9C0E4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIP2Q9C0E4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIP2Q9C0E4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIP2Q9C0E4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIP2Q9C0E4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIP2Q9C0E4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIP2Q9C0E4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIP2Q9C0E4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIP2Q9C0E4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIP2Q9C0E4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIP2Q9C0E4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIP2Q9C0E4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIP2Q9C0E4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIP2Q9C0E4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIP2Q9C0E4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIP2Q9C0E4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIP2Q9C0E4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIP2Q9C0E4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIP2Q9C0E4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIP2Q9C0E4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIP2Q9C0E4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIP2Q9C0E4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIP2Q9C0E4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIP2Q9C0E4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIP2Q9C0E4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIP2Q9C0E4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIP2Q9C0E4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIP2Q9C0E4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIP2Q9C0E4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIP2Q9C0E4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIP2Q9C0E4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIP2Q9C0E4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIP2Q9C0E4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIP2Q9C0E4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIP2Q9C0E4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIP2Q9C0E4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIP2Q9C0E4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIP2Q9C0E4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIP2Q9C0E4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIP2Q9C0E4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIP2Q9C0E4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIP2Q9C0E4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIP2Q9C0E4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIP2Q9C0E4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIP2Q9C0E4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIP2Q9C0E4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIP2Q9C0E4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIP2Q9C0E4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIP2Q9C0E4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIP2Q9C0E4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIP2Q9C0E4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIP2Q9C0E4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms