Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BRINP2Q9C0B6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRINP2Q9C0B6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
BRINP2Q9C0B6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
BRINP2Q9C0B6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
BRINP2Q9C0B6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRINP2Q9C0B6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
BRINP2Q9C0B6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
BRINP2Q9C0B6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
BRINP2Q9C0B6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BRINP2Q9C0B6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BRINP2Q9C0B6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRINP2Q9C0B6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRINP2Q9C0B6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRINP2Q9C0B6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRINP2Q9C0B6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRINP2Q9C0B6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRINP2Q9C0B6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRINP2Q9C0B6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRINP2Q9C0B6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRINP2Q9C0B6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRINP2Q9C0B6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRINP2Q9C0B6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRINP2Q9C0B6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRINP2Q9C0B6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRINP2Q9C0B6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRINP2Q9C0B6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRINP2Q9C0B6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRINP2Q9C0B6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRINP2Q9C0B6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRINP2Q9C0B6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRINP2Q9C0B6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRINP2Q9C0B6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRINP2Q9C0B6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRINP2Q9C0B6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRINP2Q9C0B6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRINP2Q9C0B6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRINP2Q9C0B6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRINP2Q9C0B6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRINP2Q9C0B6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRINP2Q9C0B6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP2Q9C0B6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRINP2Q9C0B6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP2Q9C0B6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRINP2Q9C0B6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP2Q9C0B6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP2Q9C0B6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP2Q9C0B6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRINP2Q9C0B6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRINP2Q9C0B6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRINP2Q9C0B6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRINP2Q9C0B6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRINP2Q9C0B6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRINP2Q9C0B6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRINP2Q9C0B6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRINP2Q9C0B6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRINP2Q9C0B6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRINP2Q9C0B6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRINP2Q9C0B6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRINP2Q9C0B6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRINP2Q9C0B6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRINP2Q9C0B6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRINP2Q9C0B6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRINP2Q9C0B6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRINP2Q9C0B6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRINP2Q9C0B6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRINP2Q9C0B6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRINP2Q9C0B6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRINP2Q9C0B6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRINP2Q9C0B6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRINP2Q9C0B6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP2Q9C0B6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRINP2Q9C0B6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP2Q9C0B6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP2Q9C0B6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP2Q9C0B6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRINP2Q9C0B6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRINP2Q9C0B6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRINP2Q9C0B6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRINP2Q9C0B6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRINP2Q9C0B6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRINP2Q9C0B6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP2Q9C0B6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRINP2Q9C0B6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRINP2Q9C0B6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRINP2Q9C0B6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP2Q9C0B6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP2Q9C0B6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP2Q9C0B6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRINP2Q9C0B6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRINP2Q9C0B6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP2Q9C0B6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP2Q9C0B6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRINP2Q9C0B6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP2Q9C0B6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP2Q9C0B6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP2Q9C0B6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP2Q9C0B6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP2Q9C0B6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP2Q9C0B6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms