Protein–RNA interactions for Protein: Q99102

MUC4, Mucin-4, humanhuman

Predictions only

Length 2,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC4Q99102 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MUC4Q99102 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC4Q99102 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MUC4Q99102 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC4Q99102 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MUC4Q99102 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MUC4Q99102 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MUC4Q99102 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC4Q99102 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MUC4Q99102 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC4Q99102 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MUC4Q99102 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MUC4Q99102 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC4Q99102 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC4Q99102 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC4Q99102 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC4Q99102 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MUC4Q99102 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC4Q99102 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC4Q99102 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC4Q99102 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC4Q99102 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC4Q99102 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC4Q99102 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MUC4Q99102 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MUC4Q99102 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MUC4Q99102 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MUC4Q99102 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MUC4Q99102 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC4Q99102 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC4Q99102 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUC4Q99102 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MUC4Q99102 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC4Q99102 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC4Q99102 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC4Q99102 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC4Q99102 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC4Q99102 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC4Q99102 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC4Q99102 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC4Q99102 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC4Q99102 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC4Q99102 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC4Q99102 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC4Q99102 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC4Q99102 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MUC4Q99102 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MUC4Q99102 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MUC4Q99102 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MUC4Q99102 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MUC4Q99102 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MUC4Q99102 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MUC4Q99102 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MUC4Q99102 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MUC4Q99102 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC4Q99102 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC4Q99102 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MUC4Q99102 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MUC4Q99102 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MUC4Q99102 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUC4Q99102 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUC4Q99102 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MUC4Q99102 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC4Q99102 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC4Q99102 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC4Q99102 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC4Q99102 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC4Q99102 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC4Q99102 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC4Q99102 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC4Q99102 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC4Q99102 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC4Q99102 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC4Q99102 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC4Q99102 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC4Q99102 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MUC4Q99102 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MUC4Q99102 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUC4Q99102 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUC4Q99102 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MUC4Q99102 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC4Q99102 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC4Q99102 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC4Q99102 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC4Q99102 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MUC4Q99102 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC4Q99102 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC4Q99102 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC4Q99102 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MUC4Q99102 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MUC4Q99102 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MUC4Q99102 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MUC4Q99102 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC4Q99102 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MUC4Q99102 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MUC4Q99102 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MUC4Q99102 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MUC4Q99102 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MUC4Q99102 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MUC4Q99102 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms